GSEA的input文件

我们在对基因进行GSEA分析的时候,input要求有两列,第一列是基因ID或者基因name,中间是制表符分隔,第二列需要是log2FD排序或者log2FD*(-log10pvalue),并进行排序,这样分布在两端的基因是差异最显著的基因。根据经验,第二种算法得出来的基因通路富集计算结果更好。

posted @ 2019-10-28 22:53  皓翔  阅读(522)  评论(0编辑  收藏  举报