小鲨鱼2018

2023年1月13日

linux 中非root用户安装R：checking whether bzip2 support suffices... configure: error: bzip2 library and headers are required

摘要： 001、问题：checking whether bzip2 support suffices... configure: error: bzip2 library and headers are required 002、解决方法：切回root，安装bzip2-devel [root@PC1 cur 阅读全文

posted @ 2023-01-13 23:05 小鲨鱼2018 阅读(855) 评论(0) 推荐(1)

非root 用户安装R：checking whether zlib support suffices... configure: error: zlib library and headers are required

摘要： 001、问题，非root用户安装R遇到如下报错： checking whether zlib support suffices... configure: error: zlib library and headers are required 002、解决方法切换为root，安装curl：阅读全文

posted @ 2023-01-13 22:55 小鲨鱼2018 阅读(383) 评论(0) 推荐(0)

安装curl过程中执行 ./configure报错：configure: error: select TLS backend(s) or disable TLS with --without-ssl.

摘要： 001、问题：configure: error: select TLS backend(s) or disable TLS with --without-ssl. 002、解决方法 [root@PC1 curl-7.87.0]# yum install openssl openssl-devel 0 阅读全文

posted @ 2023-01-13 22:51 小鲨鱼2018 阅读(2359) 评论(1) 推荐(1)

2023年1月12日

非root用户安装R：configure: WARNING: neither inconsolata.sty nor zi4.sty found: PDF vignettes and package manuals will not be rendered optimally

摘要： 001、问题 002、切回root，执行如下命令 [liujiaxin01@PC1 software]$ wget http://mirrors.ctan.org/fonts/inconsolata.zip --no-check-certificate [liujiaxin01@PC1 softwa 阅读全文

posted @ 2023-01-12 22:33 小鲨鱼2018 阅读(268) 评论(0) 推荐(0)

linux 中非root用户安装R：configure: error: libcurl >= 7.28.0 library and headers are required with support for https

摘要： 001、问题： configure: error: libcurl >= 7.28.0 library and headers are required with support for https 002、解决方法：切回root，安装curl [root@PC1 software]# wget 阅读全文

posted @ 2023-01-12 22:22 小鲨鱼2018 阅读(1543) 评论(0) 推荐(0)

linux 中下载和安装curl

摘要： 001、下载curl：官网 [root@PC1 software]# wget https://curl.se/download/curl-7.61.0.tar.gz --no-check-certificate [root@PC1 software]# ls curl-7.61.0.tar.gz 阅读全文

posted @ 2023-01-12 22:17 小鲨鱼2018 阅读(1549) 评论(0) 推荐(0)

linux 中普通用户安装R：configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available

摘要： 001、问题：configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available 002、解决方法 a、切换为root用户 [liujiaxin01@PC1 R-4.2.1]$ su - root Passw 阅读全文

posted @ 2023-01-12 22:05 小鲨鱼2018 阅读(2026) 评论(0) 推荐(0)

linux中普通用户安装R：configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not availabl

摘要： 001、问题 configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available 002、解决方法 a、切换回root用户 [liujiaxin01@PC1 R-4.2.1]$ su - root Pa 阅读全文

posted @ 2023-01-12 21:55 小鲨鱼2018 阅读(1685) 评论(0) 推荐(0)

linux 中将科学计数法表示的数值转换成普通数值、普通数值转换为科学计数法表示

摘要： 001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 snp2037 475 65 -7.77868e-06 snp5835 646 65 -7.77868e-06 snp5837 650 65 -7.77868e-0 阅读全文

posted @ 2023-01-12 11:40 小鲨鱼2018 阅读(351) 评论(0) 推荐(0)

2023年1月10日

linux 中shell脚本实现将fasta文件中每一条scaffold中的碱基转换为一行

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.fa [root@PC1 test]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 AACCCTTG TTCCCCC >chr2 CCCTTTTT CCCCCCCC TTTT >chr3 TTTTCCCC GGGG [root@PC1 阅读全文

posted @ 2023-01-10 22:36 小鲨鱼2018 阅读(77) 评论(0) 推荐(0)

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