2025年12月1日
gzip 压缩fastq文件和pigz命令压缩fastq速度对比
摘要： 001、 测试文件 (base) [b20223040323@admin2 test]$ du -ch *.fastq3.4G SRR33287865_1.fastq 002、gzip gzip -c SRR33287865_1.fastq Elapsed time: 238 003、pigz pi 阅读全文
posted @ 2025-12-01 10:11 小鲨鱼2018 阅读(6) 评论(0) 推荐(0)
对g.vcf文件进行压缩，并构建索引
摘要： 001、 对g.vcf文件进行压缩 step1：bgzip xx.g.vcf step2：tabix -p vcf xx.g.vcf.gz. 阅读全文
posted @ 2025-12-01 09:29 小鲨鱼2018 阅读(2) 评论(0) 推荐(0)
将SRA格式数据转换为fastq格式
摘要： 001、 fasterq-dump SRR33287869 -O ./fastq/ -e 2 阅读全文
posted @ 2025-12-01 09:28 小鲨鱼2018 阅读(15) 评论(0) 推荐(0)