2025年3月14日
VCFtools（v 0.1.16）使用
摘要： https://zhuanlan.zhihu.com/p/580033911 阅读全文
posted @ 2025-03-14 14:51 小鲨鱼2018 阅读(26) 评论(0) 推荐(0)
vcftools分离SNP和indel变异
摘要： 001、 分离SNP和indel vcftools --vcf snp_indel.vcf --remove-indels --recode --recode-INFO-all --out SNPs_onlyref：01、https://zhuanlan.zhihu.com/p/580033911 阅读全文
posted @ 2025-03-14 14:49 小鲨鱼2018 阅读(64) 评论(0) 推荐(0)
vcftools计算基因组观测杂合度
摘要： 001、vcftools计算基因组观测杂合度 阅读全文
posted @ 2025-03-14 11:53 小鲨鱼2018 阅读(64) 评论(0) 推荐(0)
vcftools根据个体id提取数据和删除数据
摘要： 001、vcftools根据个体id提取数据 [b20223040323@admin2 test5]$ ls ## 测试数据 id.list outcome.vcf [b20223040323@admin2 test5]$ cat id.list ## 提取的ID GMM5 GMM6 GMM7 GM 阅读全文
posted @ 2025-03-14 11:16 小鲨鱼2018 阅读(75) 评论(0) 推荐(0)