2024年2月7日
paired reads have different names:
摘要： 001、问题bwa报错如下： paired reads have different names: 002、解决方法，对fastq文件的read名进行重命名 脚本如下： ## step1: 处理 read1 awk 'END{tmp = NR / 4; split(FILENAME, a, "_") 阅读全文
posted @ 2024-02-07 20:04 小鲨鱼2018 阅读(140) 评论(0) 推荐(0)
Linux 中添加空行和删除空行
摘要： Linux 中添加空行和删除空行 阅读全文
posted @ 2024-02-07 18:04 小鲨鱼2018 阅读(25) 评论(0) 推荐(0)
fastq-dump --split-files 和 fastq-dump --split-3 的区别和联系
摘要： fastq-dump --split-files 和 fastq-dump --split-3 的区别和联系 阅读全文
posted @ 2024-02-07 17:46 小鲨鱼2018 阅读(219) 评论(0) 推荐(0)
Linux 中 仅列出指定目录下的所有文件，但是不包括目录
摘要： 001、find命令仅仅列出文件，不包括目录 a、 [root@PC1 test1]# ls ## 测试目录 dir001 dir002 dir003 file1.map file1.txt file2.map file2.txt [root@PC1 test1]# find -type f ## 阅读全文
posted @ 2024-02-07 12:49 小鲨鱼2018 阅读(140) 评论(0) 推荐(0)
Linux 中如何截取文本的最后几个字符
摘要： 001、awk输出最后的两个字符 a、 [root@PC1 test1]# ls a.txt [root@PC1 test1]# cat a.txt ## 测试数据 325dsfd3248 fdsfgeiuyeer sfdgdgherc [root@PC1 test1]# awk -F "" '{p 阅读全文
posted @ 2024-02-07 11:12 小鲨鱼2018 阅读(556) 评论(0) 推荐(0)