2022年7月18日
linux 中awk命令计算同一列相邻上数值的差
摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# cat a.txt 1570051 1570053 5188621 5178672 518870 阅读全文
posted @ 2022-07-18 23:47 小鲨鱼2018 阅读(373) 评论(0) 推荐(0)
gwas分析中根据显著性p值筛选上下游10k位点
摘要： 001、awk 实现 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# ls pvalue.bed root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# cat pvalue.bed ## 第一列染色体， 二列pos， 三列p Chr1 15700 阅读全文
posted @ 2022-07-18 18:15 小鲨鱼2018 阅读(279) 评论(0) 推荐(0)
linux 中 sort -V 选项
摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# cat a.txt Chr8 Chr4 Chr1 Chr3 Chr7 Chr10 Chr11 Chr12 Chr2 阅读全文
posted @ 2022-07-18 17:15 小鲨鱼2018 阅读(111) 评论(0) 推荐(0)
linux 中 sort命令 -k选项
摘要： sort -k选项用于指定按照哪一列进行排序。 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# ls facebook.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# cat facebook.txt google 110 阅读全文
posted @ 2022-07-18 12:43 小鲨鱼2018 阅读(1699) 评论(0) 推荐(0)
基因组索引文件xxx.fai格式
摘要： 001、由fasta文件生成fai文件 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# ls all.con.fa root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# samtools faidx all.con.fa root@DESKTOP 阅读全文
posted @ 2022-07-18 11:18 小鲨鱼2018 阅读(951) 评论(0) 推荐(0)