2022年7月13日
linux 中实现数据的每一列都对齐
摘要： 001、column -t实现 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# ls xxx.genome root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# cat xxx.genome ## 测试数据 FID1 IID1 FID2 IID2 RT EZ Z0 阅读全文
posted @ 2022-07-13 22:18 小鲨鱼2018 阅读(960) 评论(0) 推荐(1)
plink 软件 --hardy参数计算哈代温伯格平衡中 p值的来源
摘要： 基本公式： 001、计算卡方值x^2， 然后根据自由度计算p值。 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# ls result.map result.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# plink --file result --ha 阅读全文
posted @ 2022-07-13 20:14 小鲨鱼2018 阅读(1089) 评论(0) 推荐(0)
plink 软件中 --impute-sex 参数
摘要： plink 软件中--impute-sex参数：基因基因型信息推断性别（x染色体--het参数的F值，female: F < 0.2; male: F > 0.8）， 并写入数据。 001、计算f值 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# ls outcome.map o 阅读全文
posted @ 2022-07-13 10:20 小鲨鱼2018 阅读(452) 评论(0) 推荐(0)