摘要：
plink软件中 --update-map 用于更新snp的物理位置。 1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls new.pos outcome.map outcome.ped root@PC1:/home/test# cat outcome.map ## 一共10个snp 1 阅读全文
posted @ 2021-12-14 23:51
小鲨鱼2018
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R语言中统计数据框中指定字符出现的次数 1、利用unlist + sum实现 dat <- read.table("a.txt", header = F) ## 统计a.txt中e出现的次数 dat dat2 <- unlist(dat) sum(dat2 == "e") 2、利用for循环遍历实现 阅读全文
posted @ 2021-12-14 22:24
小鲨鱼2018
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linux shell中统计文本中指定单词出现的次数 1、测试数据， 统计 a.txt中e出现的总次数 root@PC1:/home/test/test# cat a.txt e r e y e u e e e g e 3 h r 1 3 e g e y e e s e e e e e 2、awk实 阅读全文
posted @ 2021-12-14 22:13
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1、测试数据如下， 实现将每行的第3个e及其以后的e替换为g root@PC1:/home/test/test# cat a.txt e r e y e u e e e g e 3 h r 1 3 e g e y e e s e e e e e 3、 root@PC1:/home/test/test 阅读全文
posted @ 2021-12-14 21:59
小鲨鱼2018
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plink中 --set-missing-var-ids 用于对缺失snpID的snp设定名称 1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls outcome.map outcome.ped root@PC1:/home/test# cat outcome.ped DOR 1 0 0 阅读全文
posted @ 2021-12-14 20:25
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1、问题，莫名其妙出现下面的问题，折腾半天也没有找出原因，后来索性暴力解决，直接解压文件看看咋回事， 解压半天提示文件损坏，。。。。 Error: File read failure. 2、重新下载文件，测试 root@PC1:/home/GWA_tutorial/2_Population_stra 阅读全文
posted @ 2021-12-14 10:25
小鲨鱼2018
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