R语言 - 随笔分类(第17页) - 小鲨鱼2018

R语言中scale函数的用法

摘要：中心化，所有项减去平均数 1、 > dat <- c(3, 6, 4, 8) > dat [1] 3 6 4 8 > mean(dat) [1] 5.2 > dat - mean(dat) ## 所有项减去平均值，中心化 [1] -2.25 0.75 -1.25 2.75 > scale(dat, 阅读全文

posted @ 2022-05-08 13:05 小鲨鱼2018 阅读(793) 评论(0) 推荐(0)

数据的中心化、标准化

摘要：一、中心化数据的中心化：所有数据减去平均数，该组数据平均值为0。 > dat <- c(3, 6, 4, 8) ## 测试数据 > dat [1] 3 6 4 8 > mean(dat) ## 平均值 [1] 5.2 > dat - mean(dat) ## 中心化，所有项减去平均值 [1] 阅读全文

posted @ 2022-05-08 12:18 小鲨鱼2018 阅读(454) 评论(0) 推荐(0)

R语言中批量加载包

摘要：方法1： > (.packages()) ## 查看已安装的包 [1] "stats" "graphics" "grDevices" "utils" "datasets" "methods" [7] "base" > candidate_pak <- c("qqman", "data.table", 阅读全文

posted @ 2022-05-08 11:02 小鲨鱼2018 阅读(378) 评论(0) 推荐(0)

R语言中如何批量安装R包

摘要：1、 > library(qqman) ## 未安装的包 Error in library(qqman) : 不存在叫‘qqman’这个名字的程辑包 > library(data.table) Error in library(data.table) : 不存在叫‘data.table’这个名字的程阅读全文

posted @ 2022-05-08 10:38 小鲨鱼2018 阅读(1010) 评论(0) 推荐(0)

R语言中curl函数

摘要：curl函数用于绘制函数的曲线。 1、 curve(x+0, -10, 10, bty="l") 2、 curve(2*x + 3, -10, 10, bty="l") 3、 curve(x^2,-5,5,bty="l") 4、 curve(x^2+3*x+1,-10,5) 5、 curve(2^x 阅读全文

posted @ 2022-05-07 22:22 小鲨鱼2018 阅读(179) 评论(0) 推荐(0)

R语言中asp参数的作用

摘要：1、asp参数用于定义绘图区域纵轴与横轴的比例 par(mfrow = c(2, 2)) plot(1:10, cex = 3, pch = 16, main = "asp = 1", cex.main = 3, asp = 1) plot(1:10, cex = 3, pch = 16, main 阅读全文

posted @ 2022-05-07 19:34 小鲨鱼2018 阅读(268) 评论(0) 推荐(0)

R语言中grep函数及grepl函数

摘要：一、grep函数 1、提取特定开头项 > dat <- c(34, 22, 43, 64, 52, 347, 54) ## 测试向量 > dat [1] 34 22 43 64 52 347 54 > grep("^3", dat) ## 从dat中检索，提取以3开头的项，返回的是索引 [1] 1 阅读全文

posted @ 2022-05-07 18:16 小鲨鱼2018 阅读(777) 评论(0) 推荐(0)

R语言绘制样本分布图

摘要：1、 library(ggplot2) Beijing <- c(116,40) ## 经纬度信息 Tokyo <- c(139, 36) Paris <- c(2, 48) Sydney <- c(150, -33) Newyork <- c(-74, 40) dat <- as.data.fra 阅读全文

posted @ 2022-05-07 14:09 小鲨鱼2018 阅读(611) 评论(0) 推荐(0)

R语言中依据列名删除指定列

摘要：1、subset实现 > a <- 1:4 > b <- 5:8 > c <- letters[1:4] > d <- LETTERS[1:4] > dat <- data.frame(a, b, c, d) > dat ## 测试数据框，共四列 a b c d 1 1 5 a A 2 2 6 b 阅读全文

posted @ 2022-05-07 09:48 小鲨鱼2018 阅读(5955) 评论(0) 推荐(0)

R语言中REmap包的安装

摘要：1、 library(devtools) install_github('lchiffon/REmap') library(REmap) 阅读全文

posted @ 2022-05-06 23:06 小鲨鱼2018 阅读(173) 评论(0) 推荐(0)

R语言中order命令依据多列对数据框进行排序

摘要：1、问题 > x <- c(1, 3, 2, 1, 2, 3) > y <- c(5, 7, 6, 8, 9, 6) > order(x) ## 返回了排序的索引 [1] 1 4 3 5 2 6 > order(y) [1] 1 3 6 2 4 5 > order(x, y) ## 当向量x相同时，阅读全文

posted @ 2022-05-06 12:44 小鲨鱼2018 阅读(580) 评论(0) 推荐(0)

Error in findPerl(verbose = verbose) : perl executable not found. Use perl= argument to specify the correct path.

摘要：1、R中gdata包读取execl数据报错 2、解决方法安装perl: 下载地址：https://strawberryperl.com/ 3、重新读取，指定perl的路径 all.counts <- read.xls('GSE61533_HTSEQ_count_results.xls', she 阅读全文

posted @ 2022-05-04 22:43 小鲨鱼2018 阅读(581) 评论(0) 推荐(0)

R语言中seq函数的用法

摘要：R语言中seq函数用于生成序列 1、 > seq(1,10) ## 指定起点和终点，默认步长为1 [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > seq(1,10, 2) ## 指定步长为2 [1] 1 3 5 7 9 > seq(1,10, 3) ## 指定步长为3 [1] 1 4 7 1 阅读全文

posted @ 2022-05-03 12:19 小鲨鱼2018 阅读(1468) 评论(0) 推荐(0)

R语言中fread函数中colClasses = "character"选项

摘要：1、测试数据 > dir() [1] "test.txt" > library(data.table) > dat <- fread("test.txt") ## 不加该参数 > dat V1 V2 1: ab 35 2: df 100 3: er 54 > class(dat$V2) [1] "i 阅读全文

posted @ 2022-05-03 12:01 小鲨鱼2018 阅读(396) 评论(0) 推荐(0)

R语言中安装包常见的3种来源

摘要：1、从cran安装(https://cran.r-project.org/) 示例： > install.packages("ggplot2") ## 安装 trying URL 'https://mirrors.bfsu.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/4.1/gg 阅读全文

posted @ 2022-05-02 13:02 小鲨鱼2018 阅读(1423) 评论(0) 推荐(0)

R语言中在指定位置处插入列、或者行

摘要：1、任意位置插入列 > a <- letters[1:5] > b <- LETTERS[1:5] > c <- sample(1:10,5) > d <- sample(letters[1:10],5) > e <- data.frame(a, b, c, d) > e ## 测试data.fra 阅读全文

posted @ 2022-05-01 00:30 小鲨鱼2018 阅读(9434) 评论(0) 推荐(0)

R语言中substr截取字符串

摘要：1、 > a <- "aaabbbcccddd" > substr(a,1,2) ## 提取字符串a的前两个字符串 [1] "aa" > a <- "aaabbbcccddd" > substr(a,3,5) ## 3-5字符 [1] "abb" > substr(a, 5,nchar(a)) ## 阅读全文

posted @ 2022-05-01 00:09 小鲨鱼2018 阅读(1310) 评论(0) 推荐(0)

R语言中nchar统计字符串的长度

摘要：1、 > a <- "abcde" > length(a) ## length统计向量的长度 [1] 1 > nchar(a) ## nchar统计字符串的长度 [1] 5 > a <- c("aaa", "b", "ccccc", "dd") > a [1] "aaa" "b" "ccccc" " 阅读全文

posted @ 2022-04-30 23:57 小鲨鱼2018 阅读(234) 评论(0) 推荐(0)

R语言中complete.cases函数和is.na函数

摘要：1、 > a <- c("a", NA, "d", "e", NA, "b") > complete.cases(a) ## 向量中不为空返回TRUE，为空则返回FALSE [1] TRUE FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE > is.na(a) ## 向量中为空返回TRUE，阅读全文

posted @ 2022-04-30 22:03 小鲨鱼2018 阅读(462) 评论(0) 推荐(0)

R语言中na.omit函数

摘要：1、应用于向量 > a <- c("d", "e", NA, "k", NA, "m") > a [1] "d" "e" NA "k" NA "m" > as.character(na.omit(a)) ## 清除向量中的空值 [1] "d" "e" "k" "m" > na.omit(a)[1:l 阅读全文

posted @ 2022-04-30 21:51 小鲨鱼2018 阅读(1036) 评论(0) 推荐(0)

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