liuhui0622

摘要： ```#!/usr/bin/perl -wuse strict;die "Usage: $0 \n" unless (@ARGV == 1);my $lines = 0;my $bases = 0;while (my $line = ){ # operator reads one line at ... 阅读全文

摘要： ```awk '/pattern/ {next} {print $0}' filename``` 阅读全文

摘要： ###格式替代符```%b 相对应的参数被视为含有要被处理的转义序列之字符串。%c ASCII字符。显示相对应参数的第一个字符%d, %i 十进制整数%e, %E, %f 浮点格式%g %e或%f转换，看哪一个较短，则删除结尾的零%G %E或%f转换，看哪一个较短，则删除结尾的零%o 不带正负号的八... 阅读全文

摘要： ``` awk '/^>/ {printf("\n%s\t",$0);next;} {printf("%s",$0);} END {printf("\n");}' / { next } { getline seq } length(seq) > 200 { print $0 "\n" seq }' > assembly.fas ``` 阅读全文

摘要： # to 2.2.30#```cd /usr/binsudo su```#```mv blastdb_aliastool blastdb_aliastool_2.25mv blastdbcheck blastdbcheck_2.25mv blastdbcmd blastdbcmd_2.25mv bl... 阅读全文

摘要： 转自 http://www.cnblogs.com/xianghang123/archive/2012/08/23/2652806.htmlLinux下安装与使用本地的perl模块在使用Linux或是unix时，perl是一个非常有用的脚本的语言。关于perl的模块安装，网上也有很多介绍，一方面可以... 阅读全文

摘要： ```#/usr/bin/perl -wuse strict;my $usage = "\n\nusage: $0 \n\n";my $length = $ARGV[0] || die $usage;&RandomSeq($ARGV[0]); # invoke the subroutinesub R... 阅读全文

摘要： ##```cat tet.sh```------------```#!/bin/bashs=0while [ $s -lt 10000 ]do let "s = $s + 1" echo $s >> /dev/null 2>&1done```##```time sh let.sh # 计算脚... 阅读全文

摘要： hexdump -C test_idex.1.bt2 | less -S 阅读全文

摘要： #### extracting lines bases a list using awk```awk 'NR==FNR{a[$1]=$0; next}($1 in a){print a[$1]"\n"$0}' file list```参考 http://521cto.blog.51cto.com/9... 阅读全文