摘要： 1. Open Anaconda prompt (can be downloaded through https://www.anaconda.com/download/) 2. Find the location for R.exe in your computer (e.g. D:\Progra 阅读全文

摘要： 来了加拿大差不多一个月了，晚上突然特别有感触，于是写点东西吧。 这一个月过得真的挺快，找了房子，然后开始每周去学校做实验室的日子。开始正常上课，然后看文章，准备演讲。这次的演讲说是准备的辛苦，其实发现应该是自己原来了解的少了，而且太久没有说英语了。 读书和工作的任务很不一样，工作的时候想着怎么多赚钱 阅读全文

摘要： 嗨，又不淡定了，护照都是17号送到签证中心的，账户里也出现了签证文件的信息还有海关信，但是查了一下还是没有寄出来。虽然说还有一周的时间，但是总觉得能早点收到就安心了。又得进入祈祷模式了，希望这周两个人都收到护照。 本来以为能开开心心去读书了，本来以为去读书了，可以改变自己的生活。但是发现其实不是，很 阅读全文

摘要： mount, 挂载U盘，mount -t vfat /dev/sdb1 /media/disk umount, 卸载， umount /home/rich/mnt df 查看磁盘空间的大小， df -h 可以将大小转换为M，G形式 du, 磁盘空间没了，显示某个特定目录的磁盘使用情况 du -c:  阅读全文

摘要： 经过了一年左右的努力，总算是在2018年7月初拿到了一个博士offer，并且是有奖学金的。现在真很难想象如果没有奖学金，我应该怎么读下去。 现在分享一下我准备学生签证的经验吧，积累些RP，保佑我的签证能在5个星期内下来，最坏最坏赶在选课之前赶到学校就好！拜托了 首先是去了上海的签证中心（久事商务大厦 阅读全文

摘要： 发现UCSC可以找到fasta格式的文件，这样就可以保证使用的单个基因的ref序列和整体的hg19序列保持一致了。 找到需要的基因，然后点击这个基因，之后出来的页面中有如下信息。点击Genomic Sequence 然后出来下面这个界面，可以自己调整上下游的区域。然后submit之后就可以看到fas 阅读全文

摘要： bed file是靶向测序中一个重要的文件，是告诉call SNP的软件，目标的基因位置在染色体的什么地方。主要用到的工具是UCSC gene browser 1.外显子的靶向文件 UCSC:http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables. 按照下表填好，把自己的目标 阅读全文

摘要： 生信分析中，很多时候需要用到sample.list, 基本上这个就是实现多样本并行的不可缺少的文件。那如果有几百个样本的fastq.gz文件，如何将快速列出一个sample.list呢？用下面这句话就可以了 ls -1 | grep "_L001_R1_001.fastq.gz$"|sed 's/_ 阅读全文

摘要： # 总核数 = 物理CPU个数 X 每颗物理CPU的核数 # 总逻辑CPU数 = 物理CPU个数 X 每颗物理CPU的核数 X 超线程数# 查看物理CPU个数cat /proc/cpuinfo| grep "physical id"| sort| uniq| wc -l# 查看每个物理CPU中cor 阅读全文

摘要： 让下面这句代码帮你完成，n个文件和n个md5值的文件的校对吧 cat *.md5 | parallel -j 10 --pipe -N1 md5sum -c {} 之后parallel还有其他一些妙用，可以参考博主的文章http://blog.chinaunix.net/uid-20662820-i 阅读全文