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摘要： 1. 如何对 fastq 数据进行过滤？ 推荐使用 fastp fastp -i <fastq1> -I <fastq2> -o <fastq1.clean> -O <fastq2.clean> -w <cpus> -j <qc.json> -h <qc.html> 2. 如何使用 bwa mem 阅读全文

摘要： sam/bam 是一种序列比对格式标准，由sanger制定，是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示，当然也可以表示任意的多重比对结果。通常是把FASTQ文件格式的测序数据比对到对应的参考基因组版本得到的。 header 部分 sam 分为两部分，注释信息（ 阅读全文

摘要： 基本局部比对搜索工具 (BLAST) 可查找两个序列之间具有局部相似性的区域。该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较，并计算匹配的统计显着性。BLAST 可用于推断序列之间的功能和进化关系，以及帮助识别基因家族的成员。 下载与安装 下载地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih. 阅读全文