liangjinghui

摘要： 拟时序分析是模拟各个组织之间的发育过程，这里需要根据差异基因进行分析，不同差异基因、不同的软件、不同的参数得到的轨迹是天差地别的，如使用seurat选择的高变基因，使用clusters差异表达基因，使用monocle选择的高变基因。另外细胞组织类型的选择，也有很大的影响。我建议大家都把主流差异基因计算的轨迹都算一次，算出20个左右，然后根据真实的发育规律判断哪一个轨迹适合放到文章里，如叶片一定从叶原基起源，叶原基分布在茎尖分生组织SAM中，所以SAM一定是轨迹开端，需要根据实际情况而选择。 阅读全文

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