[置顶] Scissor：整合scRNAseq和RNAseq数据识别表型相关细胞
摘要： Scissor 什么是 Scissor 算法？ Scissor 算法，Single-Cell Identification of Subpopulations with bulk Sample phenOtype coRrelation。此算法用于整合单细胞转录组数据和 bulk 转录组数据，鉴定和 阅读全文
posted @ 2026-07-19 16:18 生信刘学长 阅读(38) 评论(0) 推荐(0)
2026年7月18日
bulkRNA转录组分析: 主成分分析（PCA）
摘要： 引子 来自Nature的一项研究，使用人群SNP特征（Single Nucleotide Polymorphism，单核苷酸多态性）进行PCA分析，结果展示了与欧洲的地理地图呈现出明显的相似性。来自同一地理区域的个体会聚集在一起,主要的族群彼此可以区分开来。地理位置相邻的群体在图上通常也彼此紧邻,并 阅读全文
posted @ 2026-07-18 17:04 生信刘学长 阅读(32) 评论(0) 推荐(0)
2018年12月11日
使用Modeller对蛋白质进行同源建模
摘要： # Anaconda 一、modeller下载与安装 输入key码：MODELIRANJE 做下Basic Modeling 流程吧： 在python环境下运行下例子吧：（build_profile.py、compare.py、align2d.py、model-single.py、evaluate_ 阅读全文
posted @ 2018-12-11 14:22 生信刘学长 阅读(5010) 评论(0) 推荐(0)
2018年10月19日
基于序列比对的系统发育分析
摘要： # Thanks .这是scut系统发育学课程论文。 1、简介： 进化生物学是指研究不同生物在一段时期中的改变，其目的是提供理论，进而解释生物多样性的过程和机制。与证据充足的生物学相比，支持进化生物学的确凿证据并不多，往往只能通过其他生物学分支学科提供的例证来形成理论，形成的理论来解释这些例证。譬如 阅读全文
posted @ 2018-10-19 13:09 生信刘学长 阅读(6736) 评论(0) 推荐(1)