PYMOL分子比对

两种方式：

一，分子全局比对

1）导入第一个分子；

2）导入第二个分子；

3）选中第一个分子》A》align》to molecule》选中第二个分子

此时，会出现较多黄黄的线，难看死了；我猜全局比对只适合高度同源的分子；

 

二，分子局部比对

1）导入第一个分子；

2）导入第二个分子；

3）选择第一个分子的比对氨基酸序列，并重新命名A；

4）选择第二个分子的比对氨基酸序列，并重新命名B；

5）第一个分子的部分氨基酸序列对象A》A》align》to selection》第二个分子部分氨基酸序列对象B;

部分比对的示意图如下