摘要: graph to tree非常有趣! 距离的度量会极大地影响后续的分析,欧式距离会放大差异,相关性会缩小差异,导致某些细胞群分不开。 先直观看一下,第一个是Prim,第二个是Kruskal。但是肯定都是有局限性的!我也在尝试新的方法,提升表现。 先看看算法的差异: 参考: 话说最小生成树的prim算 阅读全文
posted @ 2019-04-17 18:08 Life·Intelligence 阅读(412) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 2023年03月20日 想找到一个peak文件里富集的motif,MEME可以用网页版,HOMER可以用本地版,速度也很快,最多4行命令。 conda install -c bioconda homer perl /home/zz950/softwares/miniconda3/envs/cutru 阅读全文
posted @ 2019-04-17 12:49 Life·Intelligence 阅读(26220) 评论(0) 推荐(0) 编辑
TOP