支持MPI的hdf5库的编译

作者：朱金灿

来源：http://blog.csdn.net/clever101

 

  因为最近要研究并行I/O，据说hdf5文件格式可以支持并行I/O，深度学习框架Caffe用的是hdf格式，所以决定把hdf5库的源码编译一下。

 

   首先得安装MPI的开发环境mpich2-1.2.1p1-win-ia32.msi（配套VS2008），然后到hdf5-1.10.0-patch1下载hdf5的最新源码，然后使用CMake生成VS工程文件，需要注意的是CMake设置的编译选项默认是不支持并行的，因此需要把HDF5_ENABLE_PARALLEL这个选项选上，同时HDF5_ENABLE_PARALLEL这个编译选项和HDF5_BUILD_CPP_LIB是互相冲突的，因此不能编译为C++库，只能编译为C库，也就是说hdf5的C++库不支持并行I/O，hdf5的C库才支持并行I/O，具体如下图：

       这样可以生成一个叫HDF5.sln的解决方案文件，里面的工程很多，一般只需要编译hdf5-shared和hdf5-static两个工程即可，具体如下图：

        编译好了hdf5库后，接下来测试使用只需要包含hdf5.h和链接对应的库文件件即可。需要注意的是使用hdf5的动态库需要增加一个预处理器:H5_BUILT_AS_DYNAMIC_LIB，在hdf5的官网上就有这样一句提示：

To use the shared libraries on Windows with Visual Studio you must specify the H5_BUILT_AS_DYNAMIC_LIB compile definition.

 

       hdf5-1.10.0-patch1的源码及对应的VS2008解决方案已上传至CSDN：支持MPI的hdf5最新源码工程。