摘要：$cat exit.sh testvcf=$1 if [ ! -f $testvcf ];then echo "testvcf nonexist :$testvcf" exit 0 fi echo "run successful" $ cat run_Exit.sh sh exit.sh 3err 阅读全文

摘要：要解决的是每次都要输入密码，所以不能后台投递任务。 解决方案： 核心是expect spawn #!/usr/bin/expect -f set timeout 10 set username [lindex $argv 0] set password [lindex $argv 1] set ho 阅读全文

摘要：核心 如设置便捷su #!/usr/bin/expect -f set port port_no set user st_mchri_bigdata set password Genomics20210 set timeout -1 spawn su $user expect "*assword:* 阅读全文

摘要：集群个人目录下的.bashrc不要涉及source/export路径，不然有些盘故障，就会影响任何形式的访问。 1. 登陆卡住 2.scp 卡住 解决方法： 涉及路径的自定义环境变量可以写在如 ~/profile.sh这样的脚本里边，在使用时在shell里边source ~/profile.sh使环 阅读全文

摘要：setfacl -m u:st_mchri_bigdata:rxw -R /jdfssz1/ST_HEALTH/P21Z10200N0047/lizhichao/data_transfer setfacl -m u:st_rm:rx -R /zfssz3/ST_MCHRI/BIGDATA/autoa 阅读全文

摘要：行尾$替换为 \ 注：空格\ 第一行行首加tar czvf 压缩后文件前缀.tar.gz 最后一行行尾可以加 && echo "done" 结果如下： tar czvf test.tar.gz COVIDHarbin.list.csv \COVIDHarbin.list.csv_copy \COVI 阅读全文

摘要：sort 命令 默认是打印出来，可以通过定向符> 或-o 指定输出文件 -t ' ' 指定分隔符为空格 -k 指定按分隔后的第几域排序 -n 按数值大小排序，默认是升序（从小到大） -r 表示逆序 reverse sort -t ' ' -k 1 sort_test.file # 对第一域默认按AS 阅读全文

摘要：文件前几行 head -n 5 $file 文件后几行 tail -n -5 $file 文件从第几行到结尾 tail -n +5 $file 区间行的文件 sed -n '2,5p' $file # 第二行到第5行 阅读全文

摘要：if [ ! -d "./shell" ];then mkdir ./shell fi # 注意[]内的各个空格 阅读全文

摘要：# 注 mac 要用gwak代替awk. ~/Documents/materials/linux_shell  awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} NR==FNR{a[$3]=$1;b[$3]=$2} NR>FNR{$2=a[$1];$3=b[$1]; {print $2,$3,$1} 阅读全文

摘要：BUG ： 解决方法： 在profile 勾选unlimited scrollback 阅读全文

摘要：find 命令 查找，搭配exec 对查找到的文件操作。 -exec 后跟command,终止以；结尾，考虑到分号在不同系统中的不同含义，所以习惯用\;转译。 花括号{}指代前面find查找到文件。 例子： find . -type f -exec ls -l {} \; find -type f 阅读全文

摘要：>替换shell字符串： echo ${string/23/bb} //abc1bb42341 替换一次 echo ${string//23/bb} //abc1bb4bb41 双斜杠替换所有匹配 echo ${string/#abc/bb} //bb12342341 #以什么开头来匹配，根php中 阅读全文

摘要：最简单的方式是下载编译后的软件：*.static.gz 1.如： wget https://github.com/biod/sambamba/releases/download/v0.7.1/sambamba-0.7.1-linux-static.gz2.gunzip sambamba-0.7.1- 阅读全文

摘要：str="this is a string" [[ $str =~ "this" ]] && echo "$str contains this" 判断文件： if [ -f $fq1 ]then fq2=`ls /home/input${RGID}/*_2.fq.gz`else fq1=`ls /h 阅读全文

摘要：nl /etc/passwd |sed '2,5 d' 删除文件2-5行nl命令 输出的文件内容自动加上行号 sed [-nefr] [动作] 以行为单位 注意： 在-i 时，mac 与linux稍有不同，需要加空格，如 sed -i '' '/CMDCB0003112/d' 467gvcf.lis 阅读全文

摘要：用python file.write("\n".join(line_list)) 方式将多行内容组成的列表写入文件。文件末行没有换行符， 因此vi打开文件会因为如同window系统一般的文件结尾，提示：[noeol] 且，less |wc-l 的方式数行数会比实际行数少一行。 这样的输出文件用pyt 阅读全文

摘要：1. convert安装： 2. 遇到的问题： 3.该问题解决办法： 网上有这样的，亲测：不管用。pass contributed：对于没有运行Web服务器的桌面用户，只需消除这些限制就足够了。为此目的，可以删除文件，或重命名该文件。因此，所有政策都取消了，但如果需要，您仍可以恢复. 因为我的工具就 阅读全文

摘要：注 ：1、*) 相当于其他语言中的default。 2、除了*)模式，各个分支中;;是必须的，;;相当于其他语言中的break 3、 | 分割多个模式，相当于or 参考：https://blog.csdn.net/love__coder/article/details/7262160 阅读全文

摘要：Git 简介： Git 是处理文本文件的版本管理系统。 Github获取Git的提交历史，并保存在互联网，以供远程（联网）访问。 工作过程： 1）创建本地分支，在本地分支编辑，修改，提交。 2）push到远程分支 3）申请merge到主分支，发布请求 Pull Request 4）审核merge 5 阅读全文