摘要: 一、蛋白质相互作用的基本动力学 蛋白质之间的结合和解离可以用动力学参数来描述: 结合速率常数(k_on):表示蛋白质结合形成复合物的速度。 解离速率常数(k_off):表示复合物解离为单独蛋白质的速度。 解离常数(K_d = k_off / k_on):反映结合的亲和力,K_d越小,亲和力越强,解离 阅读全文
posted @ 2025-03-11 11:49 kehan 阅读(632) 评论(0) 推荐(0)
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posted @ 2024-06-11 19:47 kehan 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 参考 https://valdes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/dev/installation/ mpi4py和cupy的联合应用(anaconda环境):GPU-aware MPI + Python GPU arrays - Angry_Panda - 博客 阅读全文
posted @ 2024-06-04 21:03 kehan 阅读(294) 评论(0) 推荐(0)
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posted @ 2023-11-28 15:19 kehan 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
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posted @ 2023-11-26 22:23 kehan 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
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posted @ 2023-11-25 21:06 kehan 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. # coding=utf-8 import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.model_selection import train_test_split from skl 阅读全文
posted @ 2023-11-18 14:14 kehan 阅读(96) 评论(0) 推荐(0)
摘要: #usage python renumber.py -i xxx.pdb -a -r > new.pdb class Pdb(object): """ Object that allows operations with protein files in PDB format. """ def __ 阅读全文
posted @ 2023-09-16 11:52 kehan 阅读(59) 评论(0) 推荐(0)
摘要: using gromacs to write a script for protein-protein complex moleculer dynamics from force field selection to trajectory analyze step by step,and give 阅读全文
posted @ 2023-04-25 09:40 kehan 阅读(353) 评论(0) 推荐(0)
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posted @ 2022-04-17 20:51 kehan 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)