摘要: 如何定义一个区域的开放程度(accessibility): 染色体是盘曲折叠的一个存在,那么有功能的区域就不能缠绕过紧(缠绕太紧TF就binding不上去了),也就是说有功能的区域更开放,更裸露。 这样一来我们就需要找那个区域是更开放的也就是accessibility高,ATAC-seq 就是用来找 阅读全文
posted @ 2020-08-27 21:01 爱吃鱼的喵~ 阅读(203) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 二代测序技术流程: 1.首先我们有很多个细胞混合在一起,从中取出需要测序的DNA,随机打断成无数的小片段(250-300bp); 2. 把这些DNA片段放到一起; 3. 对这些片段进行测序,每一个片段的序列可以成为read; 二代测序技术基础分析 1. mapping,将reads 都找到在基因组上 阅读全文
posted @ 2020-04-07 23:00 爱吃鱼的喵~ 阅读(527) 评论(0) 推荐(0)