随笔分类 -  基因组组装

基因组组装相关流程、方法、软件
摘要:报错信息 Forward and reverse reads not paired. Check that BAM files have the same read names and are sorted. 分析 提示是没有排序或者R1、R2没有配对,手动sort再分步运行HiC-Pro samt 阅读全文
posted @ 2021-12-21 16:54 Johnson海马体 阅读(1035) 评论(0) 推荐(0)
摘要:染色体共线性可视化基因组组装质量的评估手段之一就是用现有的参考基因组和组装的基因组进行共线性分析,级别有全基因组的共线性分析和染色体级别的共线性分析 阅读全文
posted @ 2021-08-17 11:40 Johnson海马体 阅读(1987) 评论(0) 推荐(0)
摘要:Hi-C互作热图作图神器-HiCPlotterHiCPlotter is a Python data visualization tool for integrating different data types with interaction matrixes 阅读全文
posted @ 2021-08-11 10:14 Johnson海马体 阅读(5327) 评论(0) 推荐(0)