文件权限问题导致plink报错 Failed to open 21JAN.log. Try changing the --out parameter.
晚上兴起,想起一直以来没有解决的问题,于是复制一个目录,开始跑数据,但是跑到第一步就采坑
plink --chr-set 95 --file merge --mind 0.1 --geno 0.1 --maf 0.05 --chr 1-18 --recode --out 21JAN
报错,(没有复制全)
Failed to open 21JAN.log. Try changing the --out parameter.
找了半天原因,网上也没找到,后来想起可能是权限问题,于是
sudo chmod -R 777 testyy
居然跑通了
把权限改到755 ,错误又变了
PLINK v1.90b6.22 64-bit (16 Apr 2021)          www.cog-genomics.org/plink/1.9/
(C) 2005-2021 Shaun Purcell, Christopher Chang   GNU General Public License v3
Logging to 21JAN.log.
Options in effect:
   --chr 1-18
   --chr-set 95
   --file merge
   --geno 0.1
   --maf 0.05
   --mind 0.1
   --out 21JAN
   --recode
31470 MB RAM detected; reserving 15735 MB for main workspace.
做个笔记
    人在中年,一事无成,瞎学
                    
                
                
            
        
浙公网安备 33010602011771号