miniconda配置及常用命令，windows系统环境变量设置

安装完miniconda后，如果cmd中输入"conda info"没有输出信息，说明需要手动配置环境变量。

（1）右键点击桌面上“此电脑”，点击“属性”

（2）在弹出的页面里点击“高级系统设置”

（3）点击“环境变量”

（4）双击“系统变量”里面的"Path"：

（5）点击“新建”，输入最下面三行路径：

D:\miniconda3\
D:\miniconda3\Scripts
D:\miniconda3\Library\bin

（6）打开cmd，输入conda info，看到信息说明配置成功

（7）如果要添加国内镜像源，就输入如下指令

添加清华镜像源：

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

设置安装包时，显示源：

conda config --set show_channel_urls yes

如果不想换了，删除清华镜像源：

conda config --remove channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

要看现在使用了哪些源：

conda config --show channels

（8）创虚拟环境，删虚拟环境，查虚拟环境

创建虚拟环境：

conda create --name myenv python=3.9

删除虚拟环境：

conda remove --name myenv --all

查看所有虚拟环境：

conda env list

conda常用命令

// 查看版本号
conda --version

// 升级
conda update conda

// 查看镜像源
conda config --get channels

// 恢复默认镜像源
conda config --remove-key channels

// 查看已安装库
conda list

// 更新指定库
conda update env_name

// 删除环境中某个库
conda remove --name env_name gatk

// 清除缓存
conda clean --all

// 激活虚拟环境
conda activate env_name

// 指定某个环境中更新包
conda update -n env_name <package_name> -y

// 环境重命名
conda rename -n old_name new_name

// 克隆环境
conda create --name new_env_name --clone old_env_name

// 查看conda更新历史
conda list --revision

// 回退到某个历史版本
conda install --revision 2

canda镜像源

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

更改canda虚拟环境位置

默认位置在：C:\Users\server_wins.conda\envs
默认安装包：C:\Users\server_wins.conda\pkgs
默认配置文件：C:\Users\server_wins.condarc

envs_dirs:
  - D:\conda\envs

pkgs_dirs:
  - D:\conda\pkgs