随笔分类 -  Linux

搭建高性能计算环境（十）、应用软件的安装之Wien2k
摘要：1，首先安装fftwtar xvf fftw-3.3.4.tar.gzcd fftw-3.3.4./configure --prefix=/opt/fftw-3.3.4 --enable-shared --enable-float --enable-mpi CC=icc F77=ifortmake... 阅读全文
posted @ 2014-11-22 19:45 iDove 阅读(2160) 评论(0) 推荐(1)
搭建高性能计算环境（九）、应用软件的安装之gaussian 09
摘要：高斯软件一般使用的都是编译好的二进制版，所以解压缩后设置一下环境变量就可以用了。cd /opttar xvf g09.tar.gz设置环境变量，添加到/etc/profile文件中，重新登录后生效。export g09root=/optsource $g09root/g09/bsd/g09.pro... 阅读全文
posted @ 2014-11-22 11:37 iDove 阅读(4328) 评论(0) 推荐(1)
搭建高性能计算环境（八）、应用软件的安装之gromacs
摘要：1，下载安装新版本的gcc（高版本的gcc只是推荐使用的，系统自带的gcc4.4照样能正常编译、运行）wget http://ftp.tsukuba.wide.ad.jp/software/gcc/releases/gcc-4.8.2/gcc-4.8.2.tar.bz2tar xvf gcc-4.8... 阅读全文
posted @ 2014-11-21 10:55 iDove 阅读(3027) 评论(0) 推荐(0)
搭建高性能计算环境（七）、应用软件的安装之MS
摘要：1，上传软件包MaterialsStudio70.tgz、msi_7.lic到服务器上。2，安装ms一般会创建一个普通用户msi，软件安装在msi账号下。创建用户msi： useradd msi切换到msi用户： su – msitar xvf /opt/MaterialsStudio7... 阅读全文
posted @ 2014-11-19 22:03 iDove 阅读(6400) 评论(0) 推荐(0)
搭建高性能计算环境（一）、Linux操作系统的安装和配置
摘要：一般课题组刚开始做计算，往往没有专门的集群，主要用自己的PC机、工作站或者买几台服务器来跑跑；小伙伴们摸索Linux的使用、编译一些开源软件、甚至写点Shell脚本需要耗费很多时间，耽搁了读文献、码论文的进展。在此写几篇Blog，将Linux系统的安装、设置，常用软件的安装、编译整理出来，分享给大家... 阅读全文
posted @ 2014-11-13 09:32 iDove 阅读(3379) 评论(1) 推荐(0)