2014年5月
机器学习中的数学(2)-线性回归，偏差、方差权衡
摘要： 版权声明： 本文由LeftNotEasy所有，发布于http://leftnoteasy.cnblogs.com。如果转载，请注明出处，在未经作者同意下将本文用于商业用途，将追究其法律责任。如果有问题，请联系作者 wheeleast@gmail.com前言： 距离上次发文章，也快有半个月的时间了，这... 阅读全文
posted @ 2014-05-13 08:54 hzs319 阅读(169) 评论(0) 推荐(0)
机器学习中的数学(1)-回归(regression)、梯度下降(gradient descent)
摘要： 版权声明： 本文由LeftNotEasy所有，发布于http://leftnoteasy.cnblogs.com。如果转载，请注明出处，在未经作者同意下将本文用于商业用途，将追究其法律责任。前言: 上次写过一篇关于贝叶斯概率论的数学，最近时间比较紧，coding的任务比较重，不过还是抽空看了一些机器... 阅读全文
posted @ 2014-05-13 08:53 hzs319 阅读(306) 评论(0) 推荐(0)
limma包的使用技巧
摘要： limmar package是一个功能比较全的包，既含有cDNA芯片的RAW data输入、前处理（归一化）功能，同时也有差异化基因分析的“线性”算法（limma: Linear Models for Microarray Data），特别是对于“多因素实验（multifactor designed... 阅读全文
posted @ 2014-05-06 16:44 hzs319 阅读(17221) 评论(0) 推荐(0)
2014年3月
多重比较校正中的一些概念
摘要： 关于多重比较校正，虽然曾经查过很多东西，也大概记住一些，但最近发现没留下多少正确的印象。所以又温习了一遍，稍加整理，留备后用。当然，这些还是我自己的理解，如果有不对的地方，还请指出 :)主要内容均来自wikipedia以及这个网页.假设我们手上有一枚硬币，想通过抛10次硬币的方法检验它的金属分布是否... 阅读全文
posted @ 2014-03-24 16:58 hzs319 阅读(1711) 评论(0) 推荐(1)
关联规则：R与SAS的比较
摘要： 啤酒和尿布的故事是关联分析方法最经典的案例，而用于关联分析的Apriori算法更是十大数据挖掘算法之一（http://www.cs.uvm.edu/~icdm/algorithms/index.shtml，这个排名虽然是几年前的调查结果，但是其重要性仍可见一斑）。本文以《R and Data Min... 阅读全文
posted @ 2014-03-24 09:08 hzs319 阅读(858) 评论(0) 推荐(0)
支持向量机通俗导论（理解SVM的三层境界）
摘要： 支持向量机通俗导论（理解SVM的三层境界）作者：July、pluskid ；致谢：白石、JerryLead出处：结构之法算法之道blog。前言 动笔写这个支持向量机(support vector machine)是费了不少劲和困难的，原因很简单，一者这个东西本身就并不好懂，要深入学习和... 阅读全文
posted @ 2014-03-18 10:17 hzs319 阅读(278) 评论(0) 推荐(0)
主成分分析在生命科学研究中的应用
摘要： 主成分分析常常用于基因组全序列表达研究，但是，到底什么是主成分分析？如何将这种方法用于对高维度数据的分析中呢？ 生命科学研究中采用的一些测定方法，对每个样品所采集的数据的变量要多于所测定的样品数。例如，DNA芯片及质谱仪可以对上百个样品中数以千计的mRNAs或蛋白质水平进行测定。诸如此类的高维度测定... 阅读全文
posted @ 2014-03-13 11:32 hzs319 阅读(913) 评论(0) 推荐(0)
[循证理论与实践] Meta分析系列之五：贝叶斯 Meta 分析与 WinBUGS 软件
摘要： 贝叶斯Meta分析（Bayesian Meta-Analysis）是近年来基于贝叶斯统计发展起来的一种新型的Meta分析方法，主要采用“马尔科夫链—蒙特卡罗”（Markov chain Monte Carlo，MCMC）方法、使用WinBUGS软件进行。1、 起源与发展英国数学家Bayes T于17... 阅读全文
posted @ 2014-03-11 12:41 hzs319 阅读(3956) 评论(0) 推荐(0)
[循证理论与实践] Meta分析系列之六：间接比较及网状 Meta 分析
摘要： 在临床实践中，经常会碰到没有直接比较的证据或者需要从众多干预措施中选择对患者最佳措施的情况，此时，研究者往往会从随机对照试验（RCT）中寻找间接证据，这就形成了间接比较的Meta分析或多种干预措施比较的Meta分析（网状Meta分析）。1、间接比较Meta分析间接比较（indirect compar... 阅读全文
posted @ 2014-03-11 12:41 hzs319 阅读(4236) 评论(0) 推荐(0)
[循证理论与实践] Meta分析系列之四：观察性研究的质量评价工具
摘要： 观察性研究（observational study）又称非实验性研究(non-experimental study），是指没有加入研究人员的任何干预（试验的或其他方面）措施，允许事件自然发展的研究过程 ，与随机对照试验相比，观察性研究更容易受到偏倚风险影响，发生选择性偏倚的风险大于实验性研究。观察性... 阅读全文
posted @ 2014-03-11 12:40 hzs319 阅读(9203) 评论(0) 推荐(0)