摘要：
简要回忆下，第一次使用是在大四，傻傻的用，老师教了一个定制所显示的列，就觉得神奇的不得了。uniprot 提供了可供编程的api，这样大大简化了处理流程。http://www.uniprot.org/help/programmatic_access不过，在进行batch retrieve时，没有提供... 阅读全文
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用david搞定了所有的GOterm后，接下来就是利用goslim处理这些term。用的包是goatools，需要下载几个obo文件以及，fisher，pygraphviz以及graphviz等几个模块。# -*- coding: utf-8 -*-"""Created on Fri Nov 21 ... 阅读全文
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开始是打算用protein gi number，获得他们的go term。 本来想用uniprot来解决，不过想需要convert ID，这其中会导致有的ID对应不正常，一是缺失了；而是一对多，或者多对一。数据至少还要重新整理一次。后来想到了david，先手动提交数据，而且要是多个物种的，他还不让整... 阅读全文
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看完了一遍，没有太大感觉。以后再补吧。 阅读全文
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主要交了估计的方法和一些注意事项。应该是很有用，但是没仔细看啊。以后再说。 阅读全文
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---恢复内容开始---We propose an approach based on the idea that cluster centers are characterizedby a higher density than their neighbors and by a relativel... 阅读全文
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# -*- coding: utf-8 -*-"""Created on Wed Nov 05 15:18:17 2014@author: dell"""import pandas as pdimport numpy as npimport datetimeimport matplotlib.pyp... 阅读全文
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# -*- coding: utf-8 -*-"""Created on Tue Nov 04 21:22:29 2014@author: dell"""import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltx, y = np.meshgrid(np.li... 阅读全文
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http://nbviewer.ipython.org/github/EnricoGiampieri/dataplot/blob/master/statplot.ipynb没找到直接的接口的使用方法。上述连接。 阅读全文
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# -*- coding: utf-8 -*-"""Created on Tue Nov 04 15:46:32 2014@author: dell"""import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltif __name__ == '__main__... 阅读全文