随笔分类 -  Computational Chemistry

计算化学之路
Road to Computational Chemistry
摘要：Initial Motivation ======= 1 OCT 2015 2015年，我正式确定未来的事业 学习理论计算化学。其中的原因很简单，因为我不喜欢做实验。我想将自己的两项长处：编程能力和化学积累结合起来。 事实上，我在这两方面并不像自己所想的那样，都达到了很高很深的程度。更准确地说，我是 阅读全文
posted @ 2016-08-17 01:46 羽夜 阅读(529) 评论(1) 推荐(0)
[矩阵计算]Davidson对角化
摘要：更新： 8 AUG 2016 花了几个礼拜写程序终于跑过Davidson对角化！至此，Davidson对角化的思路已经完全清晰。如尚有不准确之处，请务必回复指出！ 一、Davidson对角化的思路 Davidson对角化是一种快速求出大规模稀疏矩阵的方法，对于求量子体系中$\textbf{H}|C\ 阅读全文
posted @ 2016-08-09 10:57 羽夜 阅读(3961) 评论(2) 推荐(0)
完全组态相互作用（Full CI）
摘要：更新：27 JUL 2016 前面说Hartree-Fock理论可以分子的电子能级，即分子轨道（MO）。分子轨道是描述单个电子的波函数，如果写成空间-自旋四维函数\(\psi(\textbf{r},\sigma)\)则称为自旋轨道（spin orbital），如果分离出其中的空间部分\(\varphi(\textbf{r})\)则称为空间轨道（spacial orbital）。以下讨论专指... 阅读全文
posted @ 2016-07-28 10:00 羽夜 阅读(2472) 评论(0) 推荐(0)
分析力学复习笔记（更新中）
摘要：更新：5 MAY 2016 教材：理论力学（第二版）金尚年、马永利编著，高等教育出版社 开始时间：6:39 PM 第一章 牛顿力学方程 1.1 牛顿与《原理》 经典力学的时空观：绝对时间、绝对空间、绝对运动。 惯性参考系：相对于绝对空间作匀速直线运动的参考系。 牛顿力学定律与伽利略变换 牛顿哲学推理 阅读全文
posted @ 2016-05-05 19:02 羽夜 阅读(2853) 评论(0) 推荐(1)
电子结构引论读书笔记：第三章-Hartree-Fock近似
摘要：更新：4 MAY 2016 3.1 Hartree-Fock方程 一般的Hartree-Fock积分-微分方程： \(h(1)\chi_a(1)+\sum\limits_{b\neq a}\left[\int d\textbf{x}_2|\chi_b(2)|^2r_{12}^{-1}\right]\chi_a(1)-\sum\limits_{b\neq a}\left[\int d\text... 阅读全文
posted @ 2016-05-04 10:48 羽夜 阅读(1586) 评论(0) 推荐(0)
电子结构引论读书笔记：第二章-多电子波函数和算符
摘要：更新：3 MAY 2016 多电子哈密顿算符的一般写法： \(\mathscr{H}=-\sum\limits_{i=1}^{N}\dfrac{1}{2}\nabla_i^2-\sum\limits_{A=1}^{M}\dfrac{1}{2M_A}\nabla_A^2-\sum\limits_{i=1}^{N}\sum\limits_{A=1}^{M}\dfrac{Z_A}{r_{iA}}+\... 阅读全文
posted @ 2016-05-03 12:28 羽夜 阅读(1368) 评论(2) 推荐(0)
Hartree-Fock理论（更新中）
摘要：预备知识： 基组 分子轨道基本概念与Hartree Product 平均场与Fock算符 在忽略分子中电子的相互作用时，我们有了一个粗糙的模型，虽然非常容易求解，但是描述的精确程度非常差。 考虑电子的相互作用（即电子相关electron correlation），Hartree-Fock理论以静态场的形式表达，其单个电子的哈密顿量增加平均电场项，成为 \(\large h_i=-\fr... 阅读全文
posted @ 2016-03-09 07:24 羽夜 阅读(2937) 评论(0) 推荐(0)
计算化学中的基组：基础
摘要：Term: Basis set 基组的概念： 量子化学中的基组是用于描述体系波函数的若干具有一定性质的函数。基组是量子化学从头计算的基础，在量子化学中有着非常重要的意义。基组的概念最早脱胎于原子轨道，随着量子化学的发展，基组的概念已经大大扩展，现已不局限于原子轨道的原始概念。在量子化学计算中，根据体 阅读全文
posted @ 2016-02-26 05:36 羽夜 阅读(8414) 评论(0) 推荐(2)
半经验分子轨道方法：初步印象（更新中）
摘要：分子轨道理论的两条发展思路： 1.向快速计算发展 – 可以计算更大体系 2.向精确计算发展 Term: Semiempirical implementations of MO 半经验分子轨道方法 半经验方法的核心思路：各种简化久期行列式 半经验方法的具体形式： 1.EHT: Extended Hückel Theory扩展休克尔理论 2.CNDO: Complete Neglect of Diff... 阅读全文
posted @ 2016-02-26 01:34 羽夜 阅读(1025) 评论(0) 推荐(0)
分子轨道理论：基本要素与单电子轨道
摘要：更新：7 MAR 2016 Terms: Molecular Orbital Theory, MO 分子轨道 【出发点】薛定谔方程：算符/哈密顿量 – 轨道/波函数 – 本征值 【哈密顿量】能量算符，在无外场情况下，写成动能项和势能项两部分，即原子核单体动能（负）、电子单体动能（负）、原子核之间相斥 阅读全文
posted @ 2016-02-26 00:22 羽夜 阅读(3634) 评论(0) 推荐(0)
分子力学：初步印象（更新中）
摘要：参考教材：《分子动力学的理论与实践》陈正隆 Term: Molecular Mechanics分子力学; Molecular Dynamics 分子动力学 【势能面】单个分子或者极少的多分子的能量与结构的计算核心是势能面（PES）。势能面的实质是体系能量对各个自由度的高维向量/函数。势能面上的局部极 阅读全文
posted @ 2016-01-29 06:27 羽夜 阅读(772) 评论(0) 推荐(0)