一、利用3D Slicer分割标注胸部肿瘤

一、参考博客

        具体的分割标注的过程可以参考这个博客:3D Slicer 图像分割标注教程

二、数据来源

        首先我们需要一个CT数据,并且需要可以观察到病灶,数据可以从这里下载,里面有清晰的病灶。

         数据: https://continuousregistration.grand-challenge.org/data/

        选择POPI:

        

 

        点击下载链接下载任意一个病人的mhd数据

        注意每个数据都是包括两个部分:.mhd文件和.raw文件,当我们需要打开的时候点击.mhd文件,其中记录的是头信息

 三、视频教程

        参考博客里面对于如何进行分割没有说,所以我只是用了自己了解的一种方法,但感觉不是最好的。

         下面有一个视频介绍了具体的显示过程:

         视频:肿瘤分割标注

         如果有任何建议欢迎提出来。

         https://www.bilibili.com/video/BV1t7411S7fn

四、补充

        视频里面,在segment Editor里面,使用Threshold设置域值之后,要点击里面的 use for mask

posted @ 2020-04-03 20:44  星光夜  阅读(1856)  评论(0)    收藏  举报