如何在JVM上执行Java文件呢？为什么Java文件本质上要在JVM中运行？

首先我们写个 HelloWorld.java
接下来有两步：编译.java，运行.java
进行编译：

zhangjg@linux:/deve/workspace/HelloJava/src$ javac HelloWorld.java 
zhangjg@linux:/deve/workspace/HelloJava/src$ ls
HelloWorld.class  HelloWorld.java

javac命令的意思是：java complier
编译出来一个新的文件：HelloWord.class
进行运行：（注意 我们并不是运行这个新编译出来的class文件）

zhangjg@linux:/deve/workspace/HelloJava/src$ java -classpath . HelloWorld 
HelloWorld

从上面的过程可以看到， 我们在运行Java版的HelloWorld程序的时候， 敲入的命令并不是 ./HelloWorld.class 。 因为class文件并不是可以直接被操作系统识别的二进制可执行文件 。 我们敲入的是java这个命令。 这个命令说明， 我们首先启动的是一个叫做java的程序， 这个java程序在运行起来之后就是一个JVM进程实例。

下面详细的说一下上面这个编译-运行的步骤：（虽然很verbose,但是好好读一下）
java命令首先启动虚拟机进程，虚拟机进程成功启动后，读取参数“HelloWorld”，把他作为初始类加载到内存，对这个类进行初始化和动态链接（关于类的初始化和动态链接会在后面的博客中介绍），然后从这个类的main方法开始执行。也就是说我们的.class文件不是直接被系统加载后直接在cpu上执行的，而是被一个叫做虚拟机的进程托管的。首先必须虚拟机进程启动就绪，然后由虚拟机中的类加载器加载必要的class文件，包括jdk中的基础类（如String和Object等），然后由虚拟机进程解释class字节码指令，把这些字节码指令翻译成本机cpu能够识别的指令，才能在cpu上运行。
从这个层面上来看，在执行一个所谓的java程序的时候，真真正正在执行的是一个叫做Java虚拟机的进程，而不是我们写的一个个的class文件。这个叫做虚拟机的进程处理一些底层的操作，比如内存的分配和释放等等。我们编写的class文件只是虚拟机进程执行时需要的“原料”。这些“原料”在运行时被加载到虚拟机中，被虚拟机解释执行，以控制虚拟机实现我们java代码中所定义的一些相对高层的操作，比如创建一个文件等，可以将class文件中的信息看做对虚拟机的控制信息，也就是一种虚拟指令。

更多信息请参见：
深入理解Java虚拟机到底是什么