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生信相关的笔记
一点利用lme4包进行BLUP/BLUE计算的DEMO
摘要：df=data.frame( Y=c(101,101,100,99,201,201,200,199,51,51,50,49), X2=c("1","1","1",'1','2','2','2','2','3','3','3','3'), X=c(1,1,1,1,2,2,2,2,3,3,3,3), R 阅读全文
posted @ 2021-07-11 22:50 esctrionsit 阅读(844) 评论(0) 推荐(0)
GWAS学习笔记（一） | 质量控制（QC）
摘要：本系列文章采用的数据集与代码来自https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial。 该教程获得了许多人的推荐，是一份很详细的step-by-step guide。 本文将介绍该教程中的QC部分（1_QC_GWAS.zip），后续或将继续添加有关QC的其他细节。 0. 阅读全文
posted @ 2020-08-01 16:31 esctrionsit 阅读(3996) 评论(0) 推荐(0)
hmmlearn使用简介
摘要：隐含马尔可夫模型（Hidden Markov Model，HMM）最初是在20世纪60年代后半期，由Leonard E. Baum和其他一些作者在一系列统计学论文中描述的。其最初应用于语音识别领域。 1980年代后半期，HMM开始应用到生物序列，尤其是DNA序列的分析中。随后，在生物信息学领域，HM 阅读全文
posted @ 2020-08-01 16:05 esctrionsit 阅读(6554) 评论(2) 推荐(0)