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2015年10月17日
Linux 在一个命令行上执行多个命令
摘要: Linux 在一个命令行上执行多个命令1. [ ; ]如果被分号(;)所分隔的命令会连续的执行下去,就算是错误的命令也会继续执行后面的命令。2. [ && ]如果命令被 && 所分隔,那么命令也会一直执行下去,但是中间有错误的命令存在就不会执行后面的命令,没错就直行至完为止。3. [ || ]如果每...
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posted @ 2015-10-17 09:40 emanlee
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2015年10月11日
tophat
摘要: tophat -p 4 -G filter.gtf \-o /SRR222 \/index \SRR222.fastqtophat -p 4 -G filter.gtf \-o /SRR222 \/index \SRR717.fastq,SRR718.fastqtophat -p 4 -G filt...
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posted @ 2015-10-11 21:49 emanlee
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echo输出到stderr
摘要: echo "Your error message here" >&2 This is a normal echo (which goes to stdout), however the>&2(which is shorthand for1>&2), means 'mix the stdout to ...
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posted @ 2015-10-11 15:41 emanlee
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2015年10月1日
随机森林
摘要: http://www.36dsj.com/archives/32820简介近年来,随机森林模型在界内的关注度与受欢迎程度有着显著的提升,这多半归功于它可以快速地被应用到几乎任何的数据科学问题中去,从而使人们能够高效快捷地获得第一组基准测试结果。在各种各样的问题中,随机森林一次又一次地展示出令人难以置...
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posted @ 2015-10-01 21:07 emanlee
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数据科学家应该掌握的5个工具
摘要: 本文转自:http://www.36dsj.com/archives/34020当谈及到分析你编纂的数据时,有大量的工具可以帮助你更好的理解数据,本文总结出了一个包括5个数据科学工具的列表,同时这也是你在当今的社会形势下人们应该掌握的5个数据科学工具。即使是知识渊博的数据科学家也能提升他们的技术水平...
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posted @ 2015-10-01 19:38 emanlee
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6个用于大数据分析的最好工具
摘要: 本文转自:http://www.d1net.com/bigdata/news/334735.html大数据是一个含义广泛的术语,是指数据集,如此庞大而复杂的,他们需要专门设计的硬件和软件工具进行处理。该数据集通常是万亿或EB的大小。这些数据集收集自各种各样的来源:传感器,气候信息,公开的信息,如杂志...
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posted @ 2015-10-01 19:35 emanlee
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55个最实用大数据可视化分析工具
摘要: 该文转自【IT168 技术】近年来,随着云和大数据时代的来临,数据可视化产品已经不再满足于使用传统的数据可视化工具来对数据仓库中的数据抽取、归纳并简单的展现。传统的数据可视化工具仅仅将数据加以组合,通过不同的展现方式提供给用户,用于发现数据之间的关联信息。新型的数据可视化产品必须满足互联网爆发的大数...
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posted @ 2015-10-01 19:33 emanlee
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2015年9月21日
统计tophat map上的read数量
摘要: samtools flagstat /SRA111111/SRR111222/accepted_hits.bam 78406056 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads) (1)0 + 0 duplicates78406056 + 0 map
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posted @ 2015-09-21 19:46 emanlee
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统计fastq文件中读段的数量
摘要: mycount=`cat SRR108114_new_1.fastq | wc -l` echo 'Number of clean reads, SRR108114_new_1.fastq: '$((mycount/4)) >> SRR108114.stat mycount=`cat SRR1081...
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posted @ 2015-09-21 18:36 emanlee
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2015年9月16日
傅里叶变换
摘要: 傅里叶级数 https://www.cnblogs.com/emanlee/p/18670115 傅里叶变换是一种线性积分变换,用于将信号从时域(或空域)转换到频域。它由傅里叶级数推广而来,能够描述函数中包含的不同频率的正弦或余弦函数的振幅。 傅里叶变换的公式 傅里叶变换的公式如下: 傅里叶变
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posted @ 2015-09-16 13:20 emanlee
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