emanlee - 博客园

2017年11月14日

Cannot retrieve metalink for repository: epel 错误解决办法

摘要： centos下安装完EPEL源, 然后更新一下yum缓存, 如果发现这样的错误:Error: Cannot retrieve metalink for repository: epel. Please verify its path and try again这就表明需要更新CA证书了，那么只需要更阅读全文

posted @ 2017-11-14 23:41 emanlee 阅读(4368) 评论(0) 推荐(1)

2017年10月21日

sed 替换换行回车

摘要： A carriage return linefeed (CRLF) is a special sequence of characters, used by DOS/Windows, to signify the end of a line of text. However, in *nix, on 阅读全文

posted @ 2017-10-21 05:47 emanlee 阅读(2500) 评论(0) 推荐(0)

2017年10月7日

Get and Set Column/Row Names for Data Frames

摘要： row.names(x)row.names(x) <- value rownames(x, do.NULL = TRUE, prefix = "row") rownames(x) <- value colnames(x, do.NULL = TRUE, prefix = "col") colname 阅读全文

posted @ 2017-10-07 22:26 emanlee 阅读(362) 评论(0) 推荐(0)

TCGA phenotype各列的含义

摘要： REF: https://puma.princeton.edu/cgi-bin/tools/viewSchema.pl?table=CLINICAL_SAMPLE http://isb-cancer-genomics-cloud.readthedocs.io/en/latest/sections/p 阅读全文

posted @ 2017-10-07 21:41 emanlee 阅读(6549) 评论(0) 推荐(0)

2017年9月22日

R语言格式化数字

摘要： https://www.r-bloggers.com/number-formatting/ https://stackoverflow.com/questions/3443687/formatting-decimal-places-in-r https://stat.ethz.ch/R-manual 阅读全文

posted @ 2017-09-22 10:33 emanlee 阅读(1249) 评论(0) 推荐(0)

2017年8月16日

qvalue: Check that you have valid p-values or use a different range of lambda

摘要： ERROR: The estimated pi0 <= 0. Check that you have valid p-values or use a different range of lambda. 重现错误的代码： ps <- runif(3e5)library(qvalue)ps <- ps 阅读全文

posted @ 2017-08-16 22:07 emanlee 阅读(1023) 评论(0) 推荐(0)

2017年8月9日

pip运行错误

摘要：错误： [root@centos64 numpy-1.13.1]# pip install numpy-1.13.1-cp27-cp27m-manylinux1_x86_64.whl Traceback (most recent call last): File "/usr/local/python 阅读全文

posted @ 2017-08-09 21:03 emanlee 阅读(3519) 评论(0) 推荐(0)

python 安装wheel .whl文件

摘要：首先得有pip没有的话安装一个。然后：pip install wheel然后：pip install 路径\文件名.whl pip --versionpip 9.0.1 from /dat3/wasp/anaconda3/lib/python3.6/site-packages (python 3.6 阅读全文

posted @ 2017-08-09 20:41 emanlee 阅读(7732) 评论(0) 推荐(0)

python字符串前面加u,r,b的含义

摘要： u/U:表示unicode字符串不是仅仅是针对中文, 可以针对任何的字符串，代表是对字符串进行unicode编码。一般英文字符在使用各种编码下, 基本都可以正常解析, 所以一般不带u；但是中文, 必须表明所需编码, 否则一旦编码转换就会出现乱码。建议所有编码方式采用utf8。r/R:非转义的原始字符阅读全文

posted @ 2017-08-09 16:46 emanlee 阅读(729) 评论(0) 推荐(0)

linux下gzip的压缩详解

摘要： Linux压缩保留源文件的方法： gzip -c filename > filename.gz Linux解压缩保留源文件的方法： gunzip -c filename.gz > filename gunzip的用法1.作用 gunzip命令作用是解压文件，使用权限是所有用户。 2.格式 gunzi 阅读全文

posted @ 2017-08-09 15:05 emanlee 阅读(7718) 评论(0) 推荐(0)