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posted @ 2021-06-30 23:12
emanlee
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posted @ 2021-06-30 23:04
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posted @ 2021-06-30 22:45
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https://www.bilibili.com/video/BV1s741117Sk 分离细胞：导致细胞活性下降 beads捕获mRNA效率不同 逆转录和扩增：偏好 每个细胞内线粒体基因的比例（含量）<10% 每个细胞中基因检测（表达）的数量(2000-4000)？？？ 每个细胞中RNA 的cou 阅读全文
posted @ 2021-06-30 22:37
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Q1、10X单细胞测序可以研究什么RNA？ 10X单细胞测序利用polyT标记polyA，因此含有polyA的mRNA可以通过10X单细胞测序方法进行研究，包括真核生物的mRNA，部分lncRNA，以及有polyA的部分病毒的RNA。不含有polyA的RNA，如miRNA，circRNA、原核生物的 阅读全文
posted @ 2021-06-30 17:28
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单细胞转录组 从研究方向看上，发育生物学、免疫、神经生物学、肿瘤是排名靠前的方向，这和我们平时遇到的高频研究方向基本吻合。另外，作为一个新兴的领域，10X 单细胞转录组检测到细胞多，数据庞大，信息复杂，对数据分析带来诸多困难，因此算法类的文章（Computational method）也高达76篇。 阅读全文
posted @ 2021-06-30 17:14
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在有些情况下，细胞是很难完整分离的，比如长期保存的组织，或者大脑细胞和脂肪细胞。在分离细胞时所用的酶和破坏力往往会影响其他细胞区室的内容。此时，单核RNA测序就显得特别重要。 细胞核转录组是否代表了整个细胞的转录组，以及在snRNA-seq中发现的基因是否或多或少与特定研究相关。一些比较单细胞RNA 阅读全文
posted @ 2021-06-30 12:47
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From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两个方面，分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因组测序目前主要有两种扩增方法：MAL 阅读全文
posted @ 2021-06-30 09:19
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