摘要: 1、查看已加载的包(.packages())注意外面的括号和前面的点不能省。 包被安装后,在使用前需要加载。加载包使用命令 library(包名),比如library(codetools)。 查看有哪些包是被加载的,使用命令(.packages()) ,注意小括号和点号不能省略。 2、卸除已加载的包 阅读全文
posted @ 2020-11-01 23:04 emanlee 阅读(11700) 评论(0) 推荐(0)
摘要: ERROR: failed to lock directory ‘/usr/lib64/R/library’ for modifyingTry removing ‘/usr/lib64/R/library/00LOCK-stringi’ 出现错误提示:ERROR: failed to lock di 阅读全文
posted @ 2020-11-01 21:57 emanlee 阅读(1569) 评论(0) 推荐(0)
摘要: clusterProfiler也是通过KEGG API去获取物种对应的pathway注释,对于已有pathway注释的物种,我们只需要知道对应的三字母缩写, clusterProfiler就会联网自动获取该物种的pathway注释信息。 在clusterProfiler中,enrichKEGG(KE 阅读全文
posted @ 2020-11-01 21:53 emanlee 阅读(1619) 评论(0) 推荐(0)
摘要: pdf("h20.pdf",width =6,height = 5 ) plot ... dev.off() 第一种png格式 png(file="myplot.png", bg="transparent") 画图程序 dev.off() 第二种jpeg格式 jpeg(file="myplot.jp 阅读全文
posted @ 2020-11-01 21:10 emanlee 阅读(808) 评论(0) 推荐(0)