2019 年 1月 21 日随笔档案 - emanlee

2019年1月21日

摘要： fastqc用于查看测序数据的质量。 1.下载： http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html#fastqc wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects 阅读全文

posted @ 2019-01-21 12:05 emanlee 阅读(1432) 评论(0) 推荐(1)

Trim Galore用法及参数考量

摘要： Trim Galore是一个非常流行的用于「去接头序列」的软件，用于处理高通量测序得到的原始数据。通常我们从测序公司拿到数据后，第一步就是评估数据的质量以及对raw data去接头处理。公司拿来的数据通常附带了clean data以及去接头的说明文件，我自己重新实现了一下trim的过程。参数都是根据阅读全文

posted @ 2019-01-21 12:04 emanlee 阅读(8104) 评论(0) 推荐(0)