Dotman

摘要： 简单总结下碰到这个问题可能的原因： 最常见的，就是磁盘空间真的满了，这个时候你只能rm一些不需要的文件来解决问题 还有可能是inode不足了，这个跟磁盘当初是怎么格式化的有关，如果有太多细碎文件确实有可能出现明明还有空间但是inode却用完了的情况。可以通过df -ih来查看inode使用情况。解决 阅读全文

摘要： 本来说blog全面转移至dootmaan.github.io，然后cnblogs不再更新的，但现在想想有些东西还只能在cnblogs上面写，放在个人主页里面反而不合适。 今天这个事其实就是关于Linux上的alias命令。alias有很多妙用。在配置和维护实验室服务器的过程中，我很喜欢写一些文档，要 阅读全文

摘要： 在前几年的分割实验中偶尔会碰到模型训练完后输出全是0的情况，前几天又碰到了一次，于是想着干脆把这个频发问题开个随笔记录和总结一下。 先说结论，一般来说导致这个问题的原因可能有： lr太大了。这是个看起来比较弱智的原因，但是有的时候确实是这样的。对于一些结构特殊的模型按照往常的经验设置lr往往会导致该 阅读全文

摘要： 今年MICCAI刚开完，poster session发现一个和我之前实验motivation相似但做法完全不同的工作。东南亚小哥有点口音，给我很热情的解释，聊了半天终于给我看明白了。 文章名为《Point-Unet: A Context-Aware Point-Based Neural Networ 阅读全文

摘要： 这是今年发表在MICCAI2021上的论文，也就是我前几篇文章提到最近一直在做的事情。 实不相瞒，这个工作很大程度上是受到CVPR 2020上DSRL那篇文章的启发。当时导师就表示DSRL这个工作很有意思，idea很简单，文章写得很清晰，可以循着思路做下去。 一开始我也没想明白要怎么做下去，所以只是 阅读全文

摘要： 这篇文章和《Widening the Focus: Biomedical Image Segmentation Challenges and the Underestimated Role of Patch Sampling and Inference Strategies》是MICCAI 2020 阅读全文

摘要： 这个问题其实在很多论文里都有提到。很多论文会说我这个网络在测试时只需要其中的某某部分，其他的可以通过剪枝剪掉，但在实际科研或者论文复现中（比如我上一篇的DSRL论文介绍），这个剪枝往往很少有人关注。 实际上这个如果真的要放到实际应用中还是很有用的，下面将以Pytorch为例介绍下到底怎么才叫剪枝。原 阅读全文

摘要： 做医学图像时，SimpleITK是一个很常用的库。实际上大家往往喜欢把不同类型的数据割裂开，nrrd用pynrrd处理，dicom用dicom处理，nii用nibabel处理……实际上根本没必要，SimpleITK完全可以统一处理，各种类型的读取和保存一步搞定。 1. 读取 首先是最常见的DICOM 阅读全文

摘要： 软链接在Linux下的指令是： ln -s [source] [target] 在Ubuntu下如果source被删除会导致软链接也被对应删除，很神奇（一般情况下source被删除软链接就变成死链接了）。 软链接其实就是一个文件然后存储着到source的路径，而硬链接则是指向同一个inode的另一个 阅读全文

摘要： 以前看论文没有记录的习惯，往往是看完做个ppt，组会上看着ppt上的图乱讲一通就结束了。这样的话其实看了跟没看一样，因为根本没有从中借鉴到可用的东西。不过有一说一，也是累了，很多论文一看实验数据好得不得了，我兴高采烈clone下来代码或者自己复现之后发现平平无奇甚至有的还在负优化，久而久之对每篇论文 阅读全文