今天找了好久，终于搞清楚了，scriptManager控件支持js智能感知，而从其继承的toolkitScriptManager不支持。至少在vs2008b2中是这样。
要在js文件中添加asp.net ajax的js智能感知（与scriptManager控件无关），在js文件的开头添加这样一行即可：
///<reference name="MicrosoftAjax.js"/>
若要在aspx文件中添加智能感知，网上很多都说可以在ScriptManager标记内添加
<Scripts>
<asp:ScriptReference Path="
" />
</Scripts>
不过我基于toolkitScriptManager如此尝试仍然失败了，最后自己把C:\Program Files\Microsoft ASP.NET\ASP.NET 2.0 AJAX Extensions\v1.0.61025\MicrosoftAjaxLibrary\System.Web.Extensions\1.0.61025.0目录下的MicrosoftAjax.js文件拷贝到project的js目录下，然后用传统的js方式引用
<script src="js/MicrosoftAjax.js" type="text/javascript"></script>
居然成功地获得了智能感知，只是这两天写程序的时候发现，这样写会引起莫名其妙的运行时冲突，如果是为了拥有智能感知，那么在运行时需要把这一行注释掉再运行。
要在js文件中添加asp.net ajax的js智能感知（与scriptManager控件无关），在js文件的开头添加这样一行即可：
///<reference name="MicrosoftAjax.js"/><Scripts> <asp:ScriptReference Path="" /></Scripts> <script src="js/MicrosoftAjax.js" type="text/javascript"></script>
