centOS系统及相关软件安装
centOS系统及相关软件安装
内部安装和使用方法都是基于最简单使用方法，还可以进一步设置改善，安装和使用方法多整理于相关网页链接。内容包含：
1.安装内容包括：（1）centOS 7系统安装；（2）xrdp远程环境安装；（3）cuda安装；（4）Anaconda管理软件安装；（5）pycharm安装；（6）Lumerical仿真安装；（7）matlab 2015安装；（8）samba服务器的安装；（9）以及一些linux系统的操作；
2.一些小问题的解决：matlab安装完出现远程闪退连接不上的解决方法、系统中英文环境切换、linux多种桌面切换设置、用户权限设置；
3.一些问题：matlab 2016及以上版本在centOS7远程上存在启动界面卡死的问题，即网上有“Matlab freeze on the splash screen”的Topic，但是没有很好的解决方法。
1 安装centOS系统
centOS系统相比于Ubuntu系统更加稳定，在安装包时能够很好的安装相关依赖包，是RedHat的免费发行版本。
1.1 安装步骤
1.寻找镜像源，选择”centOS 7.9.2009 everything“的iso镜像进行安装。
（1）选择“163.com”提供的镜像，网址为：
everything版本装好多个模块，包含图形界面。如果选择minimum版本也可以，但是要在命令行自动安装桌面。
2.利用ultraSO制作U盘启动盘；
1.2 其他
（1）一些命令语句
# 当前版本说明
$ uname -r
3.10.0-1160.el7.x86_64
$ python -v
,当前版本python 2.7
（2）系统中英文环境切换
在文件"/etc/profile"末尾加入：”export LANG=en_US.UTF-8”；或者在终端输入：
$ echo 'echo LANG=en_US.UTF-8' >> /etc/proflie #在/etc/profile最后追加
$ reboot
参考链接与说明
（1）ultraISO制作镜像步骤;（link1，link2）
（2）centOS系统镜像下载；（link3）我下载的是“163.com”提供的镜像，centOS 7.9.2009 everything版本；（link4）
（3）centOS 8.1系统展示与说明；（link5）
（4）阿里云的提供的镜像（link6）和centOS镜像下载（link7）；
（5）系统中英文环境切换；（link8）
（6）yum源的添加和配置；（link9）
2 远程桌面环境安装
2.1 安装步骤
（1）安装远程相关的包
”centOS 7.9.2009 everything“默认安装的事“gnome 2”的桌面；
## 1.查询是否安装epel库
$ rpm -qa | grep epel
# 如果没有就安装
$ yum install epel-release
## 2.安装xrdp
$ yum install xrdp
## 3.安装tigervnc客户端和tigervnc-server服务器
$ yum install tigervnc
$ yum install tigervnc-server
## 4.为root用户设置密码
$ vncpasswd root
## 5.关闭seLinux
$ vim /etc/selinux/config
最后一行添加“SELINUX=disabled”
## 6.打开防火墙“3389”端口
$ firewall-cmd --permanent --zone=public --add-port=3389/tcp
$ firewall-cmd reload
（2）关闭selinux可以从系统设置里面关；或者使用命令添加设置
$ sed -i 's#SELINUX=enforcing#SELINUX=disabled#g' /etc/selinux/config
# getenforce 查看selinux状态
2.2 更换其他linux桌面
一般安装方法参考链接部分。
该版本系统默认安装的Gnome桌面。一般常用的linux桌面有：Gnome、KDE、Cinnamon、MATE、xfce等几种桌面。（之所以探究了几种桌面的安装，是因为安装高版本matlab的时候，有人提出远程matlab启动出现问题，把Gnome桌面更换成KDE桌面即可）
（1）可通过系统支持的其他桌面版本进行安装
$ yum grouplist
# 安装KDE桌面
$ yum groupinstall "KDE Plasma Workspaces"
（2）我安装的版本里面好像淘汰了通过"~/.xinitrc"设置默认启动桌面的方法，但是可以通过“~/.Xclients”设置默认启动的linux桌面，以下是我的设置方式，要启动某个桌面，只需要取消某条注释即可。
2.3 其他
（1）远程重启
$ systemctl restart xrdp
参考链接说明：
（1）windows10远程桌面连接centOS 7；（link1，link2）
（2）如果安装的不是centOS “everything”版本，只有命令行的系统界面，应该如何安装图形桌面；（link3，link3-1）
（3）各种linux桌面的介绍和安装方法；（link4）
（4）几种linux桌面系统的优劣的比较；（link5）
3 cuda安装(NVIDIA驱动安装，之后cudatoolkit通过conda安装)
cuda包含GPU计算的一些包，英伟达官网提供的cuda包含GPU驱动和cuda toolkit。以前都是直接安装cuda软件，但是有时候需要驱动先匹配才能安装cudatoolkit部分，而且不同GPU需要的驱动不一样，旧的cuda版本比较难找。此外，Anaconda中已经集成了cudatoolkit组件。所以这里我们先把NVIDIA的驱动选好安装就可以了，后面通过conda命令安装cudatoolkit部分。
3.1 安装步骤
（1）安装驱动前需要进入切换单用户安装；
## 切换为非图形界面安装（如果是远程的话，仍为图形界面，不影响；但是此步骤为必须）
$ systemctl set-default multi-user.target
（2）一些准备
a.安装基础依赖环境
$ yum install kernel-devel
b.找到“dist-blacklist.conf”文件，修改系统默认GPU设置
## 切换root用户
$ su - root
## 查看GPU系统配置文件
$ vim /lib/modprobe.d/dist-blacklist.conf
(1)注释 blacklist nvidiafb这一行
(2)文件末尾添加
blacklist nouveau
option nouveau modesest=0
（3）选择系统的相关信息，查询驱动版本；
（4）通过文件名尾缀为“.run”的文件安装；
（5）查询GPU状态
$ nvidia-smi
（6）安装完切换回图形界面，并查询
## 切换图形界面
$ systemctl set-default graphical.target
## 查询系统界面状态
$ systemctl get-default
参考链接：
（1）NVIDIA官网可以根据GPU型号和系统类型提供适配的GPU；（link1）
4 Anaconda环境安装
Anaconda可以通过清华镜像源下载安装。
4.1 安装步骤
（1）选择清华镜像源的anaconda版本，通过“wget”命令下载安装；
$ wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-2020.07-Linux-x86_64.sh
（2）建立一个新环境，指定环境的python版本，否则默认为anaconda最新匹配的python版本。
$ conda create --name pyinverse python=2.7
（3）conda安装numpy，hdf5，h5py，mpi4py，condatoolkit（单括号表示python包名，实际输入时去掉即可）
$ conda install <numpy>
## 安装cudatoolkit
$ conda install -c anaconda condatoolkit
4.2 其他
（1） 通过附加渠道安装python包
$ conda install -c conda-forge <python包名>
（2）通过阿里镜像源使用pip安装一些包
$ pip install --index-url http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/ <sympy> --trusted-host mirrors.aliyun.com
（3）其他命令
## 激活某个环境
$ conda activate <环境名>
## 查询环境中安装的python包
$ conda list
## 查询环境
$ conda env list
## 克隆python环境
$ conda create --name pyinvbk --clone pyinverse
## 卸载环境
$ conda remove -name <环境名> --all
（4）增加下载的镜像源
a. 国内镜像源网址
阿里云 http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/
中国科技大学 https://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/
豆瓣(douban) http://pypi.douban.com/simple/
清华大学 https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/
中国科学技术大学 http://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/
b. 添加与删除第三方镜像源
## 添加清华源，一般包含“free”，“main”和附加源“conda-forge”
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
# 还有一些源bioconda，msys2，pytorch
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
$ conda config --set show_channel_urls yes
## 删除某个源
$ conda config --remove channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
## 显示当前的源
$ conda config --show channels
参考链接说明：
（1）清华anaconda软件下载地址；（link1）
（2）Anaconda使用简明教程；（link2）
（3）Anaconda添加国内镜像源；（link3,lin4）
5 pycharm安装
官网下载安装即可，使用个人邮箱可注册免费使用版本。
参考链接：
（1）安装参考链接（link1）：a.注意如果安装pycharm以后导致，xrdp远程闪退打不开，可能是因为xrdp相关的包因为路径冲突覆盖了，可以在用户“~/.bashrc”文件末添加:
（1）将“/usr/bin”路径置顶
$ export PATH=/usr/bin:$PATH
# 或者命令行输入：sudo echo "export PATH=/usr/bin:$PATH"
（2）使文件生效
$ source ~/.bashrc
（2）pycharm使用——很全的教程；（link2）
6 lumerical安装
在linux系统上安装lumerical软件，如果要配合python、matlab的API一起使用，注意系统版本要求；
6.1 安装步骤
（1）按照官网安装教程安装。
（2）产生桌面图标
$ sh /opt/lumerical/v211/bin/fdtd-config.sh
参考链接：
（1）lumerical支持的系统版本；(link1)
（2）官网安装教程；
7 matlab安装
”centOS 7.9.2009 everything“这个linux系统版本上，只支持matlab 2015及以下版本（如果安装了更高版本，会在远程卡死在启动界面，但是机器上本地运行没有问题），最好安装matlab 2014版本。如果要安装更高版本的matlab，可尝试更高的系统版本。这里对matlab安装的步骤做一下说明。
7.1 matlab安装步骤
下载matlab的“.iso”镜像文件以后，执行以下操作。
（1）挂载；
$ sudo mkdir /media/matlab
$ sudo mount -o loop <matlab文件名.iso> /media/matlab
（2）按照破解步骤安装
看参考链接部分提供的教程，或者如果安装破解版，按照破解版里面的教程安装即可。
参考链接：
（1）matlab R2020a破解版下载地址；（link1）
（2）完整版安装教程，包含桌面图标如何生成；（link2）
8 安装samba服务器
samba服务器可以实现局域网内linux系统与windows，以及linux系统之间的文件交换。
8.1 安装步骤
（1）安装
$ yum install -y samba samba-client
（2）配置共享文件夹
编辑/etc/samba/smb.conf文件，共享特定文件夹在文件末尾添加如下：
[Downloads-jack]
commnet = jack's download dir
path = /home/jack
public = yes
valid user = jack
browseable = yes
writeable = yes
create mask = 0644
directory mask = 0755
（3）重启使生效
$ systemctl restart smb
参考链接：
（1）centOS 7中samba服务器的安装；（link1，link2，link3）主要参考了“link2”；
9 linux系统的一些操作
9.1 改变文件属性、拥有者、所属的用户组
## 1.chmod改变文件权限，所有人都可以读取、移动、修改,“<>”表示可选；-R用于文件夹，表示循环递归直至文件夹最里一层的所有文件
$ chmod <-R> 777 <文件夹/文件名>
## 2.chgrp改变用户组，将“filename”文件所属组改为“groupname”
$ chgrp groupname filname
## 3.chown改变文件拥有者和所属组，将文件“filea”拥有者改为用户组“groupb”中的“dzl”用户
$ chown groupb::dzl filea
9.2 用户权限配置
对用户权限进行限制，特别是限制用户是否有sudo权限。通过visudo命令安全便捷"/etc/sudoers"文件
$ visudo
参考链接：
（1）sudoers文件修改；（link1、link2、link3）参考“link1”详细说明了如何设置sudo权限，以及限制用户使用特定的命令。
浙公网安备 33010602011771号