随笔分类 -  生物信息

• 物候学与生态位模拟
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  posted @ 2021-04-27 10:37 发那个太丢人 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
• 服务器账号
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  posted @ 2021-01-13 14:34 发那个太丢人 阅读(13) 评论(0) 推荐(0)
• mummer4结果文件解读
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  posted @ 2020-12-15 11:01 发那个太丢人 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
• 切割fasta序列
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  posted @ 2020-11-20 17:14 发那个太丢人 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
• Augustus对新物种参数训练使用（以ACer为例）
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  posted @ 2020-10-13 15:24 发那个太丢人 阅读(1) 评论(0) 推荐(0)
• insert size，与fragment size
  摘要： 阅读全文
  posted @ 2020-06-26 09:58 发那个太丢人 阅读(409) 评论(0) 推荐(0)
• 基因组组装工具下载
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  posted @ 2020-03-01 10:11 发那个太丢人 阅读(3) 评论(0) 推荐(0)
• 注释基因组数据下载方法(经典，普世)
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  posted @ 2020-02-27 20:58 发那个太丢人 阅读(1) 评论(0) 推荐(0)
• 基因组注释之软件使用参数教程
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  posted @ 2020-02-21 11:54 发那个太丢人 阅读(3) 评论(0) 推荐(0)
• 注释数据库下载地址及其版本
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  posted @ 2020-02-19 15:44 发那个太丢人 阅读(6) 评论(0) 推荐(0)
• 基因组注释之重复序列及基因结构预测及注释
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  posted @ 2020-01-16 17:31 发那个太丢人 阅读(12) 评论(0) 推荐(0)
• HIC-挂载之3d-DNA-Juicer
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  posted @ 2020-01-15 10:20 发那个太丢人 阅读(15) 评论(0) 推荐(0)
• samtools中faidx索引格式
  摘要：1、faidx格式 第一列 NAME: 序列的名称，只保留“>”后，第一个空白之前的内容； 第二列 LENGTH: 序列的长度， 单位为bp； 第三列 OFFSET: 第一个碱基的偏移量， 从0开始计数，换行符也统计进行； 第四列 LINEBASES : 除了最后一行外， 其他代表序列的行的碱基数， 阅读全文
  posted @ 2020-01-14 11:28 发那个太丢人 阅读(715) 评论(0) 推荐(0)
• HIC挂载之HIC-pro
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  posted @ 2020-01-10 18:14 发那个太丢人 阅读(13) 评论(0) 推荐(0)
• 第二章，存储系统
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  posted @ 2020-01-04 00:43 发那个太丢人 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
• 计算机系统
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  posted @ 2020-01-01 16:42 发那个太丢人 阅读(22) 评论(0) 推荐(0)
• bigBed及bigWig格式
  摘要：bigBed 1、bigBed格式 BigBed文件是使用bedToBigBed程序从BED类型文件创建的。结果得到的bigBed文件是二进制索引文件。bigBed文件的主要优点是，仅将显示特定区域所需的文件部分传输到Genome浏览器服务器。因此，在处理大数据集时，bigBed的显示性能要比常规B 阅读全文
  posted @ 2019-12-28 10:16 发那个太丢人 阅读(5663) 评论(0) 推荐(0)
• bam排序及未排序，去重及未去重
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  posted @ 2019-12-21 17:29 发那个太丢人 阅读(6) 评论(0) 推荐(0)
• nanopack
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  posted @ 2019-12-17 17:21 发那个太丢人 阅读(5) 评论(0) 推荐(0)
• 群体遗传之ped格式
  摘要：1、PED简介 PED文件格式是广泛使用的用于连锁系谱数据分析的格式，并用作plink程序的输入。PLINK是一个免费的，开源的全基因组关联分析工集，旨在以高计算效率的方式执行一系列基本的，大规模的分析。PED能够处理二倍体SNP数据。 plink可以接收vcf格式文件，但是plink更倾向于自己的 阅读全文
  posted @ 2019-12-15 22:38 发那个太丢人 阅读(5370) 评论(0) 推荐(0)