Windows下利用虚拟机运行FSL 安装和配置

　　FSL是牛津大学FMRIB开发的用于分析功能磁共振影像的科研软件包。

　　运行要求：windows7或vista操作系统，10G硬盘空间，4G内存。

　　从FSL官网上下载Centos6的虚拟盘（FSLVm6_64bit.zip）解压。用VMPlayer打开其中的FSLVm6_64.vmx，运行虚拟机。

　　下载适用于CentOS6的FSL文件包（fsl-5.0.4-centos6_64.tar.gz），将其解压至虚拟机的/usr/local目录下（推荐）。修改~/.bashrc文件，添加以下内容并保存：

# User specific aliases and functions
FSLDIR=/usr/local/fsl
source ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH

　　打开terminal，输入fsl回车，就运行了。

 

几点备注：

Centos6虚拟盘和FSL文件包下载地址：http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads/fsldownloadmain.html

解压tar.gz文件命令：tar zxvf FileName.tar.gz

修改~/.bashrc文件命令：vim ~/.bashrc

在运行虚拟机后，可以运行桌面上的fslinstaller.py进行FSL的自动下载和安装，但速度太慢了。