科研 - 随笔分类 - cjbourne

bwa用法

摘要：一建立索引比对之前，需要对fasta文件构建FM-index索引：bwa index -a bwtsw hg19.fasta 生成 hg19.fasta.amb、hg19.fasta.ann、hg19.fasta.bwt、hg19.fasta.pac、hg19.fasta.sa四个文件。起可参阅读全文

posted @ 2017-01-02 22:04 cjbourne 阅读(6932) 评论(0) 推荐(0)

实验记录

摘要：Gpos 626维oA最大 Gneg 901　维最大 OA=0.9787 严格的分类 Gpos OA=0.9732 Gneg=0.9306 阅读全文

posted @ 2015-09-07 07:02 cjbourne 阅读(168) 评论(0) 推荐(0)

GO_order

摘要：Gpos Q8RP81 有GO:0000015 P47437 有GO:0000049 P06535 有GO:0000155 Q99027 有GO:0000160 P35594 有GO:0000166 ....... Q8NNK2 有GO:1902600 记为GO:0000001 GO:0000002 阅读全文

posted @ 2015-09-06 08:16 cjbourne 阅读(206) 评论(0) 推荐(0)

特征提取k_word

摘要：1) 若直接以20种氨基酸统计k_word: (以ZD98数据集为例) 维数太大不适用构造特征向量考虑氨基酸约化后特征提取约化方案：约化后的特征阅读全文

posted @ 2015-08-31 10:37 cjbourne 阅读(181) 评论(0) 推荐(0)

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