2024年5月30日
网址
摘要： github: https://github.com/CHENyiru3/ads zhihu :https://www.zhihu.com/people/djj-3-36?utm_id=0 阅读全文
posted @ 2024-05-30 13:44 chen生信 阅读(51) 评论(0) 推荐(0)
Power and sample size应用在概率题
摘要： Statistical power 统计功效是统计检验否定假原假设的概率。 我们把拒绝正确null hypothsis的错误称为type I error (\(\alpha\)) 把没有拒绝错误的null hypothesis的错误称为type II error (\(\beta\)) Sample 阅读全文
posted @ 2024-05-30 12:57 chen生信 阅读(53) 评论(0) 推荐(0)
bootstrapping
摘要： 在这段R Markdown代码中，代表bootstrapping思想的代码片段是以下几段： 这部分代码使用bootstrapping方法来估计活性（Active）和抑制（Repressed）状态下ave列的中位数： active_med <- c() repress_med <- c() for ( 阅读全文
posted @ 2024-05-30 09:11 chen生信 阅读(99) 评论(0) 推荐(0)
2024年5月29日
knit样式 + ggplot 样式
摘要： 改pdf引擎 output: pdf_document: latex_engine: xelatex knit {r setup, include=FALSE} knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) knitr::opts_chunk$set(warning = FA 阅读全文
posted @ 2024-05-29 20:05 chen生信 阅读(37) 评论(0) 推荐(1)
anova 的替代非参数方法
摘要： Kruskal-Wallis 测试是一种非参数方法，用于比较三个或更多个独立样本的中位数是否存在显著差异。在R语言中，你可以使用kruskal.test()函数来执行Kruskal-Wallis 测试。 以下是使用kruskal.test()函数的基本步骤： 准备数据：确保你的数据是向量或因子形式， 阅读全文
posted @ 2024-05-29 17:15 chen生信 阅读(153) 评论(0) 推荐(0)
2024年5月26日
Linear regression
摘要： Correlation sample correlation coefficient: r, from -1 to 1 Linear regression Assumptions: • The residuals are normally distributed and homeostatic • 阅读全文
posted @ 2024-05-26 20:22 chen生信 阅读(27) 评论(0) 推荐(0)
2024年5月25日
Kmeans聚类流程
摘要： 1. turtles Introduction In this report, we will analyze a problem related to turtle populations on a small island with two beaches: West Beach and Eas 阅读全文
posted @ 2024-05-25 18:12 chen生信 阅读(52) 评论(0) 推荐(0)
2024年5月23日
概率类题目解决笔记
摘要： 贝叶斯定理 Logical foundations Conditional probabilities we need to turn around odd number Because we already know only when we get the: condition True, bu 阅读全文
posted @ 2024-05-23 22:58 chen生信 阅读(34) 评论(0) 推荐(0)
数据清洗全流程总结
摘要： # 加载数据集 data(airquality) # 查看数据集 str(airquality) head(airquality) 查看NA colSums(is.na(airquality)) 去除NA airquality_no_na <- na.omit(airquality) 再次check 阅读全文
posted @ 2024-05-23 11:44 chen生信 阅读(92) 评论(0) 推荐(1)
提建议的解决方法
摘要： 缺乏生物学意义 需要后续研究 机制不明确，等等 increase sample size:但是必须给出统计学上的理由 Power estimation Chi-sq X是我要计算的数据集，可以是向量也可以是matrix model <- chisq.test(x) chisq_test <- mod 阅读全文
posted @ 2024-05-23 11:20 chen生信 阅读(60) 评论(0) 推荐(0)
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