随笔分类 - Python
python学习——读取染色体长度(五:从命令行输入染色体长度)
摘要:# 传递命令行参数 # 导入sys模块 import sys print(sys.argv) 命令行操作 python argv.py 10 20 30 40 50 回车输出 ['argv.py', '10', '20', '30', '40', '50'] # 方法一,删掉第0个元素 del(sy
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python学习——读取染色体长度(四:获取最长染色体的编号)
摘要:# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = {'chr1':10,'chr2':20,'chr3':30,'chr4':40,'chr5':15} # 求和 total_len = sum(chr_len.values()) # 获取键用keys for chr in chr_l
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python学习——读取染色体长度(三、用循环或者函数求总长并获取最长染色体长度)
摘要:# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = [10,20,30,40,50] # 求和 # 方法一:通过循环 total_len = 0 #定义total_len的初始长度 for len in chr_len: # 从列表chr_len中每次取一个值交给len total_le
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python学习——读取染色体长度(二、向前一步:通过染色体序列获得长度信息)
摘要:# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_seq = 'ATATATATAT' chr2_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCG' chr3_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT' chr4_seq = 'ATATATATATCGCG
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python学习——读取染色体长度(一、简化问题)
摘要:# 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_len = 10 chr2_len = 20 chr3_len = 30 chr4_len = 40 chr5_len = 50 # 求和 total_len = chr1_len + chr2_len + chr3_len + chr4_len
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