NIPT作为二代测序发展中产前诊断应用领域的典范，在目前产前诊断领域的普及十分广泛，除了针对常见非整倍体（13、18、21）的高准确率的筛查，在染色体微缺失、微重复，单基因的检测领域也在逐步开展研究和投入临床实践。NIPT利用的胎儿DNA来源于母体血浆，所谓“胎儿来源DNA”也只是胎盘的滋养细胞坏死后的DNA碎片产生，并非真正意义上的胎儿来源。因此NIPT只能作为筛查项目，发现非整倍阳性后，仍然需要进行有创操作进行确诊。既然母血中胎儿DNA并非真正源自胎儿，因此以下情况就会导致NIPT的假阳性、假阴性：
1）胎盘嵌合体（CPM）：这也是最常见的NIPT假阳性、假阴性来源，胎盘嵌合体可能分为减数分裂、有丝分裂来源的CPM，减数分裂来源的CPM主要是由于三体合子（trisomic）发生三体拯救时出现，因此可能导致整个胎盘都是三体异常的或三体细胞占比很高，而胎儿可能是整倍体，但是此情况下的胎儿也可能由于三体拯救事件发生的部位、时间等差异，导致胎儿本身也可能携带三体细胞，甚至胎儿本身存在UPD；有丝分裂来源的CPM属于合子后事件，胎儿正常，而胎盘存在部分细胞有丝分裂异常出现三体细胞，导致胎盘局部异常，从而会导致胎盘功能下降影响胎儿发育。因此，如果是有丝分裂型的CPM，可能有部分三体细胞凋亡进入母血，被NIPT检测到，导致假阳性结果，如果是减数分裂型CPM，那么胎盘可能存在大量非整倍体细胞，也会出现假阳性结果；如果胎盘中异常染色体细胞占比不高，也可能出现阴性结果，此时胎儿中的非整倍体细胞占比会高，结果会出现假阴性。
2）多胎妊娠：“vanishing twin”导致NIPT假阳性，需要加强超声检测，排除双胎之一死亡导致的假阳性结果。
3）母源CNV：如性染色体非整倍体等会导致胎儿性染色体检测异常，同时常规的染色体范围的Z值结果容易受到母源CNV的影响。
4）母源嵌合：随着母亲年龄增长血细胞中的X染色体丢失频率会增高，从而导致NIPT的假阳性结果。
5）母体肿瘤：有部分异常NIPT结果回溯发现是母体肿瘤导致，因此利用全基因组图谱有利于发现类似肿瘤的全基因组非整倍体谱。
参考文献：Brady P, Brison N, Van Den Bogaert K, de Ravel T, Peeters H, Van Esch H, Devriendt K, Legius E, Vermeesch JR. Clinical implementation of NIPT - technical and biological challenges. Clin Genet. 2016 May;89(5):523-30. doi: 10.1111/cge.12598. Epub 2015 May 4. PMID: 25867715.
