字符串相似度

这篇我们看看最长公共子序列的另一个版本,求字符串相似度(编辑距离),我也说过了,这是一个非常实用的算法,在DNA对比,网

页聚类等方面都有用武之地。

一:概念

     对于两个字符串A和B,通过基本的增删改将字符串A改成B,或者将B改成A,在改变的过程中我们使用的最少步骤称之为“编辑距离”。

比如如下的字符串:我们通过种种操作,痉挛之后编辑距离为3,不知道你看出来了没有?

二:解析

  可能大家觉得有点复杂,不好理解,我们试着把这个大问题拆分掉,将"字符串 vs 字符串“,分解成”字符 vs 字符串“,再分解

成”字符 vs 字符“。

<1> ”字符“vs”字符“

       这种情况是最简单的了,比如”A“与”B“的编辑距离很显然是1。

<2> ”字符”vs"字符串"

       ”A“改成”AB“的编辑距离为1,“A”与“ABA”的编辑距离为2。

<3>“字符串”vs“字符串”

      “ABA”和“BBA”的编辑距离为1,仔细发现我们可以得出如下结论,”ABA“是由23个子序列与”BBA“字符串求的的编辑距离集

合中取出的最小编辑距离,也就是说在这种情况下我们出现了重复计算的问题,我在求子序列”AB“和”BBA"的编辑距离时,我是由

子序列”A“和”BBA“与”B“和”BBA“之间的编辑距离中选出一个最小值,然而序列A和序列B早之前我已经计算过了,这种重复计算

的问题有点像”斐波那契”,正好满足“动态规划”中的最优子结构和重叠子问题,所以我们决定采用动态规划来解决。

 

三:公式

    跟“最长公共子序列”一样,我们采用一个二维数组来保存字符串X和Y当前的位置的最小编辑距离。

现有两个序列X={x1,x2,x3,...xi},Y={y1,y2,y3,....,yi},

设一个C[i,j]: 保存Xi与Yj的当前最小的LD。

①: 当 Xi = Yi 时,则C[i,j]=C[i-1,j-1];

②:当 Xi != Yi 时, 则C[i,j]=Min{C[i-1,j-1],C[i-1,j],C[i,j-1]};

最终我们的C[i,j]一直保存着最小的LD。

posted on 2017-12-05 10:25  比特飞流  阅读(299)  评论(0编辑  收藏  举报

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