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摘要： 在进化过程中，新基因通常来自事先存在的基因，新基因的功能从先前基因的功能进化而来。新基因的原材料 来自基因组区域的重复，这种重复可包括一个或多个基因。 作为物种形成的伴随事件而被重复，并继续保持相同功能的基因，称为直系同源基因（orthologous gene）。 新的基因功能可由在单个物种的基因组 阅读全文

摘要： 认为来自不同物种的一组基因的进化关系（基因树，gene tree）与这些物种本身的进化关系（物种树，species tree） 一定相同，似乎是合理的，因为这些基因存在于这些物种的基因组中。但情况并非如此。基因树不一定与物种树相同。 基因树可以和物种树不同，一种情况如下图所示。祖先种群最先固定了A1 阅读全文

摘要： 基因树是对一组序列进化关系真实模式的一个估计. 说基因树是一种估计,是因为在置换数目上存在随机变异,因而真实的基因树是未知的. 可以料到,在基因树中,短的分支比长的分支不可靠. 那么可用什么标准来评价某一特定分支顺序的可靠性呢?例如,在图17.1C中,那些数据是否真的可以将Mo/Ha谱系与Hu/Ba 阅读全文

摘要： devtools::install_github('royfrancis/pophelper')Downloading GitHub repo royfrancis/pophelper@masterError in utils::download.file(url, path, method = m 阅读全文

摘要： 在Linux下使用gdebi安装Rstudio,由于安装包的默认位置是在/usr/lib/R/site-library,而这些位置是需要ROOT权限的, 所以我们安装的时候总是报错,有两种办法可以解决: (1) .libPaths()查看你的安装路径,逐一给予权限 sudo chmod 755 <目 阅读全文