SMR的bug

软件主页
https://cnsgenomics.com/software/smr/#Overview

跑了几遍，每次都会有不同的报错，总结一下常见问题。

1. 统一不同的summary data的基因组版本。
2. SNP的标识不一定要转成rs编号，chr_pos_ref_alt也可以，统一即可。
3. 当snp改为chr_pos_ref_alt，因为smr运行要指定plink格式的bfile用来估计LD，所以要将bim文件的rs编号也改为chr_pos_ref_alt。
4. 对于mQTL data或者eQTL data要保证唯一性，即每个探针或基因对应的SNP不能有重复。