becky_gogogo

摘要： Single-cell mapping of the thymic stroma identifies IL-25-producing tuft epithelial cells 免疫学系，以色列魏茨曼科学研究所; 法国蒙彼利埃大学，细胞生物学系UNION PUBLIC FOR SOME KEY W 阅读全文

摘要： 最后建议去一次当地年轻人的pub酒吧，不是喝小酒的bar而是真正的迪吧才是切实英伦生活的一部分啊哈哈～ 阅读全文

摘要： 在分析了若干转录组之后发现，处理数据的时候最重要的不是技巧多么绚丽，你调包的能力有多么强。而是把基本的概念特别是统计和数学上的方法咬烂嚼吐，才是真正理解和掌握了分析数据的底层原理： 在RNA-Seq的分析中，对基因或转录本的read counts数目进行normalization是一个extreme 阅读全文

摘要： A number of tests are available to determine if a data set is distributed in a bimodal (or multimodal) fashion. Graphical methods：图想法用均值、方差、峰度、偏斜度来plo 阅读全文

摘要： 老生常谈的scRNASeq基本操作和原理： scrnaseq 的测序方法发展的年表： 在看一下列表： 分选单细胞的96孔板： 分析前的常规数据处理：FastQC、Trimming Reads、Demultiplexing（identify cell containing droplets）、usin 阅读全文

摘要： using the package “MICE” install.packages('mice')library('mice')pMiss <- function(x){sum(is.na(x))/length(x)} apply(AFE_psi[,c(12:70)], 1, pMiss)apply 阅读全文

摘要： 求二元二次方程的偏导数： > fun=expression(x^2+y^2+x*y)> D(fun,"x")2 * x + y> D(fun,"y")2 * y + x> D(D(fun,"x"),"x")[1] 2> D(D(fun,"x"),"y")[1] 1 继续：要求函数x 2 +y 2 + 阅读全文

摘要： Some biases in the standard rnaseq analysis 有参拼接：Stringtie 、 Cufflinks and Traph flow network algorithm ： maximal and minimal methods respectively 无参组 阅读全文

摘要： 做回归之我的一般操作step： scatterplot（）或者直接plot（）观测数据，选择合适的回归模型 检验异常点 检验高杠杆点 检验方差齐性 检验多重共线性（寻找共线性强的解释变量组合） 逐步回归（向前，向后，双向） 全子集回归 假设检验之后得出最优回归方程。再用方程做预测以及数据分类，降维聚 阅读全文

摘要： 鲁棒性很好的可变剪切探测 北卡2016年1月发表在Nucleic Acids Research上的一篇Methodology 当然主要是为了介绍他们的SingleSplice 软件，python脚本实现。但是we should focus on its specific strategies to 阅读全文