Baltimore System of Classifications of Viruses
巴尔的摩病毒分类系统 是病毒学家、诺贝尔将获得者 David Baltimore 根据病毒的基因组特征制定的对病毒的分类系统。此分类系统的中心思想是 所有病毒都必须从其基因组中合成正链mRNA，以便产生蛋白质并自我复制，不同病毒实现这种机制的原理各不相同。
为什么正义链RNA被放在中心法则的中心位置？
巴尔的摩分类系统基于蛋白质的翻译机制，并将mRNA置于中心法则的中心位置，描述了从DNA或者RNA基因组转录形成mRNA的途径。病毒可以复制DNA和（或）RNA，也可以从DNA合成RNA，反之亦然。但是，病毒缺乏制造蛋白质的完整系统，蛋白质的合成必须依赖于宿主细胞的核糖体。另一方面，宿主细胞只能从正义mRNA链合成蛋白质。不管病毒的基因组特征如何，所有病毒都必须合成正义mRNA链以产生病毒蛋白，迄今为止，没有例外。
怎么区分正义链和反义链？
在转录时，RNA聚合酶结合的那条链叫做 模板链，所以转录下来的mRNA的序列与 非模板链 是一致的，除了U/T替换。这条 非模板链 存储着mRNA的编码信息，叫做 编码链或者 正义链。转录下来的mRNA通常作为合成蛋白质的模板，它是 正义链，相对的，与其互补的RNA链就是 反义链。
按照病毒基因组的特性可以将病毒分为七类，每一类会根据其基因组的特性选择不同的自我赋值策略。最初设想时，巴尔的摩分类系统只涵盖了六类病毒基因组。随后发现了 gapped DNA genome of hepadnaviruses (嗜肝病毒)，并将其并入分类系统。
病毒大致可以分为七类：
- 双链DNA病毒：一些病毒在细胞核中完成自我复制，例如使用细胞蛋白的腺病毒（Adenovirus）；痘病毒（Poxvirus）在细胞质中完成自我复制，并自己制造用于复制核酸的酶
- 单正义链DNA病毒：复制发生在核内，包括形成反义DNA链，用作合成正义RNA链的模板和合成DNA，例如Parvovirus
- 双链RNA病毒：这些病毒具有分段的基因组，每个基因组片段分别转录产生单顺反子（monocistronic）mRMA，例如Reovirus
- 单正义链RNA病毒：
- 多顺反子mRNA：基因组RNA就是mRNA，单独的RNA就具有传染性，可以直接翻译产生蛋白质，被切割后形成成熟蛋白
- 复杂的转录：复制基因组RNA需要两轮或者两轮以上的翻译
- 单反义链RNA病毒：病毒的基因组是反义链，即mRNA的互补链，必须先合成正义链即mRNA链才能翻译蛋白质。这类病毒必须携带RNA聚合酶的编码，以使它们在感染细胞后能够产生mRNA
- 在生命周期中有DNA中间体的单正义链RNA病毒：病毒基因组是单正义RNA链，但它并不扮演mRNA的角色，而是作为逆转录的模板，从而产生了DNA中间体，例如逆转录病毒（Retrovirus）。逆转录病毒需要自身携带DNA聚合酶的编码，生成的DNA中间体通过宿主的RNA聚合酶II转录形成新的病毒基因组
- 带有RNA中间产物的双链DNA病毒：这类病毒也依赖于逆转录，但是与逆转录病毒不同，它发生在病毒粒子的成熟时期。感染新细胞后，首先发生的事件是缺口基因组的修复，然后再进行转录
Reference: https://microbeonline.com/baltimore-system-classifications-viruses/
