banlucainiao - 博客园

摘要： 1 首先针对数据进行分析，回答下面的问题： 1）想用聚类方法解决什么问题。是想看数据的结构，还是想把数据分为很多类，还是有其他的目的。 2）数据本身的分布。针对样本聚类还是针对变量聚类？样本可能符合怎样的分布？变量又会符合怎样的分布？ 2 选择合适... 阅读全文

posted @ 2017-04-10 16:31 banlucainiao 阅读(59) 评论(0) 推荐(0)

摘要：之前推荐过但是当时自己没有用过，现在尝试了一下，发现确定非常快。拿我的问题来说，总共3000多条序列，序列长度为1700nt，我用Phylip中最快的的Neighbor-joining计算花了一个小时以上，而且是在我的主机，而用我装的虚拟机（内存500M，计算... 阅读全文

posted @ 2017-04-10 16:16 banlucainiao 阅读(148) 评论(0) 推荐(0)

摘要： Three easy ways to download multiple sequences from NCBI There are different ways of how to download multiple sequences from t... 阅读全文

posted @ 2017-04-10 16:12 banlucainiao 阅读(97) 评论(0) 推荐(0)

摘要：一、cat 显示文件连接文件内容的工具 cat 是一个文本文件（查看）和（连接）工具，通常与more搭配使用，与more不同的是cat可以合并文件。查看一个文件的内容，用cat比较简单，就是cat后面直接接文件名。如：root@ubuntu :/# ... 阅读全文

posted @ 2017-04-10 10:43 banlucainiao 阅读(43) 评论(0) 推荐(0)

摘要：在大数据分析中，比较常用的两个数据分析包就是numpy和pandas，而pandas正是基于numpy构建的含有更高级数据结构和工具的数据分析包，在金融领域应用更是广泛。在实际的工程中，经常遇到的问题就是numpy的ndarray数据结构与pandas的se... 阅读全文

posted @ 2017-04-06 13:28 banlucainiao 阅读(54) 评论(0) 推荐(0)

摘要：卡内基梅隆大学Larry Wasserman教授统计学理论及机器学习与数据挖掘三部曲教材数据可以在作者主页下载 http://www.stat.cmu.edu/~larry/ 统计学完全教程张波译 All of Statistic... 阅读全文

posted @ 2017-04-06 11:38 banlucainiao 阅读(139) 评论(0) 推荐(0)

摘要：推荐的书单包括统计系本科生课程密切相关的中文书籍或者中译本：统计历史，统计学入门（非数学专业的统计书），数学分析，线性代数，概率论，数理统计，随机过程，R语言，大数据，金融统计，金融数学，生存分析，寿险精算，精算与风险模型。入选的标准是最近出版的书... 阅读全文

posted @ 2017-04-06 11:36 banlucainiao 阅读(86) 评论(0) 推荐(0)

摘要： 1.用命令 getwd() 获取当前工作路径 setwd()设置工作路径需要注意的是： linux下相对路径 setwd("./Rsourse")上一级目录serwd("../")绝对路径setwd("/Users/renlan/data") wind... 阅读全文

posted @ 2017-04-05 19:26 banlucainiao 阅读(116) 评论(0) 推荐(0)

摘要： Ubuntu系统已经安装了python，我们可以安装诸如numpy，scipy，pandas等第三方库以便使用，我们可以在终端输入python，然后输入import numpy等，然后使用这些第三方库。Anaconda 是 Python 科学技术包的合集，功... 阅读全文

posted @ 2017-04-03 16:11 banlucainiao 阅读(101) 评论(0) 推荐(0)

摘要： Ubuntu下设置环境变量有三种方法，一种用于当前终端，一种用于当前用户，一种用于所有用户：一：用于当前终端：在当前终端中输入：export PATH=$PATH: 不过上面的方法只适用于当前终端，一旦当前终端关闭或在另一个终端... 阅读全文

posted @ 2017-04-03 15:52 banlucainiao 阅读(61) 评论(0) 推荐(0)